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探针合成实验

相关实验:探针合成实验

最新修订时间:

材料与仪器

基因
转录缓冲液 DTT RNA酶抑制剂 CTP ATP GTP S-UTP 乙酸铵 乙酸铵 乙醇
水浴锅 离心机 培养箱 烘箱

步骤

1. 在一个含SP6、T3或T7启动子的载体中,插入目的基因。在编码序列下游酶切使质粒呈线性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以无菌水重溶沉淀至1 μg/μl。
2. 室温配罝如下反应混合液(总体积20 μl):
(1)4.0 μl 5×转录缓冲液

(2)0.2 μl 1 mol/l DTT

(3)60 U RNA酶抑制剂

(4)1.0 μl 三种10 mmol/l NTP中的每一种

(5)1.0 μl 1 μg/μl 酶切DNA

(6)10.0 μl [35S]UTP

(7)16 U SP6或T7 RNA聚合酶

(8)37℃温育30 min,再加16 U聚合酶并于37 ℃温育40 min。
3. 在反应混合液中加入:60 U RNA酶抑制剂,20 μl 10 mg/ml 的载体RNA和1.0 μl 酶1,于37℃温育10 min 以除去摸板。

4. 往反应混合液加入以下液体:0.8 μl 1 mol/l DTT、63 μl 无菌水和10 μl 3 mol/l 乙酸钠,取出1 μl 测定其 cpm/μl 值。

5. 加36.4 μl 7.5 mol/l的乙酸铵于反应混合液(终浓度2 mol/l)加50~100 μg tRNA载体和272 μl 冷无水乙醇,置干冰上沉淀10 min,以冷70%乙醇洗沉淀,晾干,需要的话可重复此步。以100 μl 10 mmol/l DTT重溶DNA沉淀。

6. 确定其 cpm/μl 值,并计算掺入百分比,核糖核酸探针应于2~3天内使用。 (70%到90%的标记掺入,结果可得70~90 ng 标记的RNA)。

来源:丁香实验

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