植物分子系统进化树的构建

植物分子系统进化分析主要是利用携带植物遗传信息的生物大分子序列（比如 DNA 序列），釆用特定的数理统计算法来构建植物物种间的系统进化关系，并用一种树状分支图的形式来概括生物间的这种亲缘关系，即系统进化树。系统进化树可分为有根树和无根树，前者以外类群作为树根，后者无外类群树根。有根树的根节点为全部分类群的最近共同祖先，能够反映各分类群间的系统进化关系，而无根树仅反映出分类群间的分类关系。利用 DNA 分子序列进行植物系统进化分析是分子进化研究的必要手段。构建系统进化树的方法主要有距离法、最大简约法、最大似然法，以及贝叶斯推断法等。要解决特定植物类群间的系统进化问题，首先要挑选合理的分类群及 DNA 序列，尽量减少数据的偏倚，然后选择合适的构树方法，随后还要对结果进行评价，并给出生物学上的解释。