亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验

RNA 实验

最新修订时间：2022-02-10

简介

亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构，亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合，插入碱基。浓度较高时，亚甲基蓝带阳离子，可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

来源：丁香实验

操作方法

亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验

一、材料与设备 1. 亚甲基蓝（MB）水溶液，2.5 mg/ml。-20℃ 避光保存。 2. [ α-32P ] 标记的 RNA。如果转录模板未被 DNase 消化，dsDNA 可以同 MB 结合而增加交联反应所需的 MB 浓度。如果操作中便用互补的 ssRNA 则需要先对其进行退火 ( 将同位素标记的 RNA 2~5 倍的互补末标记 RNA 混合，加热 5 min，室温缓慢冷却。通常在实验开