rep－PCR

PCR 技术

最新修订时间：2022-02-10

简介

rep－PCR，是基于在原核与真核生物基因组中分布着特异保守的重复序列，这些序列一般包括重复性基因外回文序列 (repetitive extragenic palindromic, REP)，肠杆菌重复性基因间共有序列 (enterobacterial repetitive intergenic consensus,ERIC)和 BOX 元件，但是如今这个概念也扩大了，它涵盖了所有用重复性 DNA 序列作引物进行 PCR 基因组指纹图谱的技术。

目前，用于 rep－PCR 的方法主要有 1 种：rep－PCR。

原理

rep－PCR 的基本原理：

rep－PCR 指的是一种方法体系，它包括用基因组中广泛存在的重复序列作引物以基因组 DNA 为模板进行 PCR 扩增的方法。这些重复序列在所有原核生物染色体中随机存在。原核细菌中的三个保守序列，一为 38 bp 重复的基因外回文结构元件 REP，另一为 126 bp 的肠杆菌重复性的基因间共有序列 ERIC，再有就是 56 bp 的 BOX 元件，它们在肠杆菌属菌株中尤其表现出序列保守性。这三个序列主要存在于革兰阴性菌中，但在真菌及古细菌中也发现了类似的重复序列的存在。

应用

rep－PCR 的常用应用领域如下：

（一）临床致病株

（二）遗传突变的细菌致病种群的分析和分类

（三）细菌分型

（四）微生物间亲缘关系的确定

（五）扩增未知 DNA 序列

来源：丁香实验团队

操作方法

rep－PCR

rep－PCR 的应用范围限于含有 REP、BOX 和 ERIC 序列（或相似序列）的细菌，但有些缺乏这些序列的菌种中会包含类似的重复性序列，就像不同的 DNA 序列信息存在于不同的微生物系统一样，新的重复性序列将会被发现，而且从整个生物界的角度来看在自然选择压力下，必然导致在几乎所有生物中都存在保守和重复序列，因此 rep－PCR 作为一种技术思路对微观和宏观的生物研究都有启发。rep－PCR