从微量样本中提取DNA。微量样本包括:微量血液样本,如低至1 μl全血;微量细胞样本,可低至100个细胞,如显微切割细胞、流式分选细胞等;或小于10 mg组织,如穿刺样本、活检样本;以及骨骼或化石等疑难样本。
从微量样本中分离 RNA,微量样本包括:微量细胞样本如低至 1 个细胞、流式分选细胞(FACS)样本;微量组织样本如低于2 μg的组织样本如穿刺样本(FNA)、激光显微切割(LMD)样本等。
环境核酸是生物与环境互作遗留的核酸,来源包括生物脱落的组织、分泌物、排泄物、血液或尸体等,分布在各种水体、土壤、沉积物或空气等环境中,是微生物和脱落DNA的混合物,这两类核酸在上述环境样本中存在较少。
游离核酸 (包括cfDNA和cfRNA) 是指在生物体液中发现的游离于细胞外的核酸,游离核酸的来源分为内源性和外源性,可以是细胞凋亡释放到体液中的内源性核酸,也可以是人体感染病原微生物后由微生物产生的外源性核酸。游离核酸可以用于癌症的早期诊断、预后评估,也可以用于病原感染的诊断,根据实验目的不同,采集体液样本类型不同,核酸纯化方案也有一定区别。
单细胞测序可以研究单个细胞内的基因情况,同时解决了用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题。但是我们常提到的单细胞测序方案并不是仅对单个或者几个细胞进行测序,而是在单细胞分辨率下对成千上万个细胞进行测序。那么如果真的只有一个细胞或极微量的核酸,又该采用什么手段对其基因组和转录组进行分析呢?单细胞/微量核酸扩增方案可以富集核酸样本,应对后续各种分子研究。
荧光定量PCR 技术可以实现RNA 的相对定量,广泛应用于分子生物学研究及疾病相关研究。QIAGEN QuantiNova PCR系列可支持包括一步法、多重等多种qPCR应用;超快速的反应体系30min即可完成实验及独特的颜色指示方案杜绝加样错误;LNA(锁核酸)技术加持增强引物或探针的灵敏度和特异性。
很多研究人员面对不足1 ng的样本往往束手无策,实际上随着生物技术和酶活性的进步,目前的技术已经可以针对10 pg样本进行全基因组建库(如需对DNA进行打断则最低起始量为20 pg)。
RNA测序 (RNA Sequencing,简称RNA-Seq) ,是基于高通量测序技术的转录组学研究方法,可以快速对基因组中的RNA种类和数量进行分析,揭示特定生物学或疾病发生过程中的分子机制。