相关专题 NCBI BLAST比对结果报告分析:BLAST是NCBI开发的一款序列相似搜索程,常用在线的BLAST比对工具进行序列比对分析和引物设计。 写在解读报告之前的,首先就使用Blast最终的目的是什么达成一致,Blast是通过两两比对,找到数据库中与输入序列最相似的序列,或者说是最相似的序列片段。那么我们看比对结果就是看Blast从数据库中找到哪些相似的序列,然后就是如何相似,这些相似又可以告诉我们哪些信息等。当然Blast
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sunshijie12345 各位大虾: 我今天看文章遇到些问题想请教下: 我在很多篇文章里看到 Human Muscle Phosphofructokinase Gene(PFKM)都说位于1号染色体上,但是我在NCBI里查询,该基因却在12号染色体上,请问我该怎么解决这一矛盾,应该相信文章还是该相信NCBI? freecell 写信给作者。 From NCBI, we know
Map viewer是NCBI 网站上提供的一个非常有用的寻找基因的工具,通过Map viewer你可以了解你感兴趣基因在基因组中所处的位置、基因序列、内含子及外显子的排列、基因的细胞遗传学图、EST.SNP等等许多有用的信息。进入Map viewer的方法如下:点击NCBI首页的Map viewer 进入Map viewer的首页,在Search下拉框内选择你寻找基因的生物种 类【eg:Homo sapiens(human)】在后面输入你基因的名称(eg:hcn
首先打开NCBI主页,大E浏览器有时候打不开,可以换个浏览器试试http://www.ncbi.nlm.nih.gov/然后按照以下步骤进行就可以了打开主页后,选择Gene,然后在后面输入目的基因名,基因后面可以加空格然后加种属缩写,不知道种属缩写也可以不加点击Search找到目的基因,注意后面标记的种属,然后点基因名进入下一页面后,向下拉,直到mRNA and Protein,点击红色数字向下拉复制序列,然后另打开NCBI主页,点右侧第五个Blast向下翻到specialized blast
5、TBLASTX是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白(每条核酸序列会产生6条可能的蛋白序列),这样每次比对会产生36种比对阵列。 NCBI的在线blast: 1,进入在线blast界面,可以选择blast特定的物种(如人,小鼠,水稻等),也可以选择blast所有的核酸或蛋白序列。不同的blast程序上面已经有了介绍。这里以常用的核酸库作为例子。