不满足HW平衡的位点处理
zhouzi肘子
各位老师，我分析了33个SNP位点，但是有7个不符合HW平衡，意思是我分析的人群不够有代表性吗？请问不满足HW平衡的位点是应该剔除吗？感谢赐教！！
3 个回答
huarenqiang5
不足HW平衡的位点建议进行踢出。
zhouzi肘子
老师您好，请问我写的时候，是第一步写所有位点进行了检测，然后剔除了不符合的位点吗？ 33个位点有8个不符合，会显得我人群没有代表性吗？
loveliufudan
不符合HW平衡的SNP位点可能有以下几种原因：
抽样误差：由于样本量太小或者抽样方法不恰当，导致基因型频率与理论值不一致。
选择压力：由于某些基因型具有适应性优势或劣势，导致其频率发生变化。
突变：由于某些基因发生突变，导致新的等位基因出现或消失。
迁移：由于某些个体从一个种群迁移到另一个种群，导致两个种群的基因流动。
非随机交配：由于某些个体倾向于与相同或不同基因型的个体交配，导致杂合子过多或过少。
在病例-对照研究中，通常会对SNP位点进行HW平衡检验，以减少抽样偏倚。如果发现某个SNP位点在对照组中不符合HW平衡，则可以考虑剔除该位点。但是，在剔除之前，还需要考虑其他可能影响结果的因素，比如实验质量、数据清洗、人口结构等。
土井挞克树
应该剔除掉的，然后选择有代表性的样本
zhouzi肘子
老师您好，因为研究的人群已经确定了，我在书写时候应该写8个不符合剔除了，还是先把这些位点删了，说所有位点符合呢？因为担心不符合的占8/33这个比例好高啊
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