蛋白质组学DIA如何进一步挑选差异蛋白

可以根据kegg富集到的信号通路挑选蛋白

在DIA分析中找不到自己关注的蛋白可能是因为样本组的生物学变异性较高或者是差异蛋白被低丰度的蛋白所淹没了，所以可以考虑挑选验证蛋白。

你提到的三种方法都是可行的，综合考虑，你可以选择挑选一些有生物学意义并且具有差异表达的蛋白进行验证。同时，也可以考虑结合其他实验数据和文献来支持验证蛋白的选择。