yutianrosy
想问一下大家,多变量孟德尔随机化的多效性检验(mr_egger的截距检验),在R语言里面是使用哪一个函数呀,在哪个包里呀?找了好多都没有找到
晓雨知春来
可以使用mr egger regression()函数。
汤姆卜丽波
一般能够用到的包:remotes、TwoSampleMR、epiDisplay、tidyr、rio
loveliufudan
在R语言中进行多变量Mendelian随机化(MR)的mr_egger截距检验,主要可以通过以下两个包实现:
1. MendelianRandomization包:
使用mr_egger()函数,可以得到mr_egger截距的估计值和p值。
2. TwoSampleMR包:
使用mr_egger_regression()函数,可以得到mr_egger截距和p值。
两个包的使用方式类似,主要步骤为:
(1)准备SNP-风险因子关联和SNP-结果关联的数据
(2)运行mr_egger()/mr_egger_regression()函数
(3)解释mr_egger截距结果
可以根据需求选择合适的R包,它们都包含了mr_egger检验的功能。
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