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求助:小鼠粪便混合菌培养,可以用PCR检测属水平目标菌丰度吗?引物怎么设计呢?

相关实验:小鼠饲养繁殖

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萌萌不萌呀

求助求助求助!!!求助各位大神

小鼠粪便混合菌培养,可以用PCR检测属水平目标菌丰度吗?如果可以的话,怎么设计引物呢?查阅文献找不到和我目标菌一样的啊,这可怎么整?

救命救命救命,要交盲审了实验还没做完,求助求助求助!!!

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2 个回答

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loveliufudan

有帮助

针对你的目标菌属,你可以根据已知的序列信息,设计一对特异性引物进行PCR扩增,然后使用定量PCR技术来定量目标菌丰度。

在设计引物时,可以使用专业的引物设计软件进行设计,如Primer3等。在选择引物时,需要考虑引物的特异性、长度、GC含量、互补性等因素,以确保引物能够特异性地扩增目标菌属的DNA序列。

如果你在查阅文献时没有找到与你目标菌属完全一致的序列信息,你可以尝试设计一对degenerate 引物。degenerate 引物可以在保持一定特异性的情况下扩增多种相似序列的目标DNA片段。在设计degenerate 引物时,需要考虑序列的保守性和变异性,以确保引物的特异性和扩增效率。

需要注意的是,PCR检测的结果可能受到多种因素的影响,包括样品的质量、DNA提取方法、PCR反应条件等。因此,在进行PCR实验时,需要仔细控制实验条件,确保实验结果的准确性和可重复性。

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土井挞克树

有帮助

可以用pcr检测,引物设计要以混合菌为模版进行设计

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