金葡PFGE一直跑不出来

tecca199

2022-10-14

求大神来助为什么我一跑金葡就这样阿条带老是降解看不清楚，跑了一个月都没有跑出个好结果优化了很多步骤还是做不出来。阴性菌做的都还行为什么一做阳性金葡就会这样呢

毛利小五郎的徒弟

2022-10-14

有帮助

条带降解可能是

（造成的原因是因为Tris缓冲液当中含义盐酸的成分被氧化，使得溶液从碱性变为酸性，二某些菌体本身在酸性的环境中容易被降解，造成我们在pfge条带图当中看不到相应的酶切位点。

如要改善这个情况，需要加入适量的硫脲到0.5X TBE中，然后在进行电泳。因为硫脲是一种还原剂，可以中和氧化物质，从而改善条带分型或一片模糊的现象

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