C57小鼠和昆明小鼠哪个实验比较好呢？

这还用考虑吗，看看sci文章几个用昆明鼠的。C57是内交系稳定遗传品种，基因遗传稳定

还是建议用C57BL的品系，尤其在你后续可能要做基因动物的时候，毕竟是Jackson实验室。

基因差异主要在于一些对比公共数据库编码序列的差异：

pde6bcds区(nm_ 008806)相比较存在如下不同;昆明小鼠706位碱基为a,而数据库中序列nm_ 008806第1149位碱基前后者为c。

c57比较好一些，适用性更广，昆明鼠地域性不太容易被接受

C57的使用比较普遍，昆明鼠很少用于正式的实验，只在教学、练习中比较多见。