流式细胞如何分析平均荧光强度？

可以利用软件啊，打开FloJo,显示工作台。找到原始数据(fcs 格式文件) Ctrl+A 将所有文件全选,鼠标将其直接拖到 All Samples 中。针对数据一进行分析：鼠标左键点击 fcs 格式数据出现流式散点图,X 轴默认选择 SSC(侧向散射,其散射强度与细胞内颗粒结构的质量正相关,即细胞圈门。对圈出细胞进行分析，双击 Lymphocytes 选中这群细胞，根据实验目的、染料所需的荧光激发 / 发射波长选择合适的横纵坐标，完成后关闭处理界面回到软件主界面。添加 MFI：选择横坐标下方的Σ Statistion，点击下面的Σ+ 打开新界面，单击左边框的 Mean，选择想要分析的 PE-A，点击 Add 添加可以使其 MFI 在Σ Statistion 框中显示。

1.先用对照设置好阈值，然后分析各个组超过荧光强度阈值的百分数的变化。2.如果没有明显的阳性，阴性阈值，可以比较整体的荧光强度的均值，中位数等等，具体采用哪个指标，要看实验目的。