丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册

基因ID转换

相关实验:传递基因进皮肤的基因枪技术

user-title

科研顺利的rong

家人们如何将这样子的编码:ENST00000331920.6:c.4237C>T转换为:NC_000009.10:g.95447452C>G这样子呀

wx-share
分享

2 个回答

user-title

毛利小五郎的徒弟

有帮助

这个需要去基因网站上进行转换,比如ncbi,进入网站把id输入后点击转换

user-title

loveliufudan

有帮助

这个编码格式看起来像是遗传学中的突变命名方式,其中包括了两个部分:基因名称和突变位置。下面是一个将这个编码转换为另一种命名方式的方法:

首先,需要找到编码所对应的基因。这可以通过 ENSTO0000331920.6 中的 ENSTO 来确定,它是一个 Ensembl 基因 ID。你可以在 Ensembl 数据库中搜索该基因 ID,并找到它对应的 NCBI 基因 ID(例如:NCBI 基因 ID 为 2200)。

接下来,需要将 c.4237C>T 这个基因突变转换为基因组坐标。这个突变表示第 4237 个核苷酸位置上的 C 被 T 取代。由于该编码来自 Ensembl 数据库,因此我们需要使用 Ensembl 基因组版本(例如:Ensembl GRCh38 版本)来确定该基因组坐标。使用基因名和版本号进行搜索,可以找到该突变对应的基因组坐标为 NC_000009.10:g.95447452C>G。

提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
扫码领资料
反馈
TOP
打开小程序