蛋白组学入门相关问题请教

蛋白组学入门可以关注以下几方面:

1. 了解蛋白组学的基本概念和研究内容

首先需要理解什么是蛋白组学,它的研究内容包括蛋白质的表达、结构、功能、互作用网络等。

2. 了解常用的蛋白质分离技术

如双向电泳、高效液相色谱、质谱技术,这些都是分离和鉴定蛋白质的重要技术。

3. 了解蛋白质组学数据库

如Swiss-Prot、Trembl等数据库,这些数据库收集了大量已知蛋白质的序列和功能信息。

4. 了解蛋白质组学研究的一般流程

从样本处理、蛋白提取、分离、鉴定、到生物信息分析,了解整个蛋白质组学研究的流程。

5. 学习一些基本的生物信息学分析工具

如蛋白质序列数据库搜索,多肽质谱匹配,这些都是蛋白鉴定的基础。

6. 阅读一些蛋白组学的入门书籍或综述文章

帮助掌握该领域的整体框架和研究热点。

总体来说,对基础技术原理和研究流程有一定了解,并学习使用基本工具,是蛋白组学入门的主要途径。后续可以通过实际操作来加深理解和提高技能。

蛋白质组（Proteome）的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组（Genome），或一个细胞、组织表达的所有蛋白质（Protein）。蛋白质组的概念结合了基因组的概念，同时引入了蛋白质的概念，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

建议学习一下蛋白质组学相应的入门知识：

蛋白质组学的研究技术

1、蛋白质分离技术

双向凝胶电泳（2DE），双向荧光差异电泳（2D-DIGE），等电聚焦电泳（IEF）,液相色谱。

多维色谱（MDC），多维液相色谱（MDLC）。

2、蛋白质鉴定技术

一级质谱：根据离子源的不同，分为基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）和电喷雾质谱（ESI- MS）。

二级质谱：肽质量指纹图谱（PMF）。

新技术：稳定同位素特征标签生物质谱(SIAMS)

主要从以下几方面准备:

一、了解蛋白组学的相关概念

二、蛋白质组学的研究内容

在平时的研究工作中，弄清楚某些样品中的蛋白质组成或者蛋白质上的翻译后修饰(PTM)位点，可以通过蛋白质组学技术对样品进行鉴定分析。如果我们想比较两组样品中蛋白质的表达差异，可以选取合适的蛋白质组学技术对样品进行相对定量分析，也就是所谓的定量蛋白质组学

(Quantitative Proteomics)定量蛋白质组

是蛋白质组学研究的重点，通过定量蛋白质组

学技术可以研究蛋白质相互作用、不同样品间差异蛋白的筛选和机制探讨(比如正常组vs基因敲除组细胞等)、药物作用靶点的筛选和验证，以及疾病生物标志物的筛选等。

三、蛋白质组学研究的基本流程

要开展一项蛋白质组学研究，通常需要经过如

下几个基本的实验流程。首先根据实验设计准

备好样品，对样品进行处理，提取样品中的蛋白质，并将蛋白质通过胰蛋白酶酶切为肽段。

将处理后的多肽样品进行质谱检测得到质谱数

据，再通过数据库检索把质谱数据转变为蛋白

质的鉴定和定量信息。最后筛选得到差异蛋白，并进行生物信息学分析，对蛋白质组学数据进行多角度的分析和挖掘。