Dfcaizjm
我用不同浓度LPS诱导细胞,发现0.1这个浓度处理细胞12小时可以诱导炎症,激活MAPK和NFKB信号通路,促进一种β防御素表达,促进细胞增殖迁移。
后期我用了30和200浓度的LPS处理细胞12 h,送出去做了个测序,现在想把两部分内容联系在一起,毕个业,怎么联系呢??请各位大佬指点迷津
汤姆卜丽波
可以分析你的测序结果啊,看看不同浓度诱导的表达有什么差异
毛利小五郎的徒弟
可以把lps做梯度浓度联系防御表达强度
loveliufudan
如果你想将两个实验结果联系起来,可以尝试进行一些生物信息学分析,例如:
基因表达分析:对于不同LPS浓度处理的细胞,可以进行转录组分析,比较不同浓度下基因表达的变化情况,以找出哪些基因在不同浓度下受到了影响。
通路分析:可以对LPS处理后的细胞进行通路分析,了解不同浓度下哪些通路被激活或抑制,以及这些通路之间的相互作用。
蛋白质互作分析:可以对细胞中的蛋白质进行互作分析,以了解不同浓度下蛋白质之间的相互作用,以及这些相互作用对于炎症和细胞增殖迁移等生物过程的调控作用。
以上这些分析都需要使用一些生物信息学软件和工具,例如DESeq2、KOBAS、STRING等。通过这些分析,可以帮助你更好地理解不同浓度下LPS处理的细胞的生物学特征,从而将两个实验结果联系起来。
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