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RBPDB(http://rbpdb.ccbr.utoronto.ca/)是RNA结合实验的数据库,包括人、小鼠、蝇和蠕虫4类物种,总共包含272个RBPs的结合数据,包括71个具有位置权重矩阵格式的基序的结合数据,以及36组免疫沉淀实验获得的体内结合转录本序列。
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iDRBP_MMC是一种新的基于序列的用于鉴定DNA结合蛋白和RNA结合蛋白的计算预测因子。采用了多标签学习和一种新颖的基于基序的卷积神经网络。它减少了DNA结合蛋白和RNA结合蛋白之间的交叉预测,并提高了识别DNA结合蛋白和RNA结合蛋白的预测性能,克服了交叉预测问题(DBP预测器倾向于将RBP预测为DBP,而RBP预测器倾向于将DBP预测为RBP),是预测核酸结合蛋白的有用工具。
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可以通过EURBPDB数据库在线查找结合蛋白