如何通过数据库查找RNA的结合蛋白

相关实验：天然 RNA 文库筛选与蛋白特异性结合的 RNA 序列实验

dxy_mnkgn3p9

2022-03-18

3 个回答

迟C迟

2022-03-20

有帮助

RBPDB（http://rbpdb.ccbr.utoronto.ca/）是RNA结合实验的数据库，包括人、小鼠、蝇和蠕虫4类物种，总共包含272个RBPs的结合数据，包括71个具有位置权重矩阵格式的基序的结合数据，以及36组免疫沉淀实验获得的体内结合转录本序列。

dxy_gwrp7ndq

2022-03-19

有帮助

iDRBP_MMC是一种新的基于序列的用于鉴定DNA结合蛋白和RNA结合蛋白的计算预测因子。采用了多标签学习和一种新颖的基于基序的卷积神经网络。它减少了DNA结合蛋白和RNA结合蛋白之间的交叉预测，并提高了识别DNA结合蛋白和RNA结合蛋白的预测性能，克服了交叉预测问题（DBP预测器倾向于将RBP预测为DBP，而RBP预测器倾向于将DBP预测为RBP），是预测核酸结合蛋白的有用工具。