dxy_und41cs0
我想请教一下 如何判定好几天rpa引物好不好用? 是同一DNA模板下 电泳 看条带亮度吗?
研究生小白阿尚
请问毛利小五郎的徒弟老师,那我看怎么文献里面都是RPA与cas12a结合呢
毛利小五郎的徒弟
因为RPA的扩增产物会激活Cas12a酶的切割活性,然后被顺式切割导致模板失效,所以不与Cas12a反应。
loveliufudan
可能的原因有几个可能:
扩增产物的长度不够:RPA(Recombinase Polymerase Amplification)扩增产物的长度一般在200-400bp之间,而Cas12a酶的作用需要靶向序列长度在23-30bp之间。因此,如果扩增产物的长度太短,可能无法被Cas12a酶识别和切割。
扩增产物的序列不符合Cas12a的靶向序列:Cas12a酶是一种特异性很高的核酸酶,需要与特定的靶向序列结合才能切割DNA。如果扩增产物的序列与Cas12a酶的靶向序列不匹配,就无法被Cas12a酶切割。
RPA扩增反应中可能存在一些成分或产物,干扰了Cas12a酶的活性:比如,RPA扩增反应中可能存在一些特定的盐、酶或试剂,这些物质可能会影响Cas12a酶的活性。此外,RPA扩增反应还可能产生一些其他的产物,如一些非特异性扩增产物或杂交产物,这些产物也可能会影响Cas12a酶的作用。
aoaaaa
谢谢!
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