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RPA扩增产物不能与Cas12a反应

相关实验:双标记签的PCR扩增

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aoaaaa

扩增模板都能与Cas12a反应酶切,RPA扩增产物却不行,为啥呀为啥呀

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4 个回答

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dxy_und41cs0

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我想请教一下 如何判定好几天rpa引物好不好用? 是同一DNA模板下 电泳 看条带亮度吗?

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研究生小白阿尚

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请问毛利小五郎的徒弟老师,那我看怎么文献里面都是RPA与cas12a结合呢

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毛利小五郎的徒弟

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因为RPA的扩增产物会激活Cas12a酶的切割活性,然后被顺式切割导致模板失效,所以不与Cas12a反应。

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loveliufudan

有帮助

可能的原因有几个可能:

扩增产物的长度不够:RPA(Recombinase Polymerase Amplification)扩增产物的长度一般在200-400bp之间,而Cas12a酶的作用需要靶向序列长度在23-30bp之间。因此,如果扩增产物的长度太短,可能无法被Cas12a酶识别和切割。

扩增产物的序列不符合Cas12a的靶向序列:Cas12a酶是一种特异性很高的核酸酶,需要与特定的靶向序列结合才能切割DNA。如果扩增产物的序列与Cas12a酶的靶向序列不匹配,就无法被Cas12a酶切割。

RPA扩增反应中可能存在一些成分或产物,干扰了Cas12a酶的活性:比如,RPA扩增反应中可能存在一些特定的盐、酶或试剂,这些物质可能会影响Cas12a酶的活性。此外,RPA扩增反应还可能产生一些其他的产物,如一些非特异性扩增产物或杂交产物,这些产物也可能会影响Cas12a酶的作用。

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aoaaaauser-title

谢谢!

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