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其实,你在丁香通上可以看到原理和步骤的。
[实验原理]
根据决定某等位基因的碱基性质,设计3′端第一个碱基分别与各等位基因的特异性碱基相匹配的序列特异性引物,在PCR 反应过程中,只有引物3′端第一个碱基与决定特定等位基因的碱基互补时才能实现DNA 片段的完全复制,根据PCR 产物的有无进行等位基因的分型。
重点是在引物设计
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1.PCR扩增PCR反应体系为20μl(2个体系,分别为引物1和引物2),含模板2μl(约50ng),引物各1.5μl,dNTP1.6μl(0.4mM),10×Buffer缓冲液2μl,Taq酶1.0U,加双蒸水至20.0μl;PCR反应条件为94℃4min,94℃1.5min/52℃2.0min/72℃2.0min,30个循环。
2.PCR 扩增产物的检测 取PCR扩增产物2μl,6%聚丙烯酰胺凝胶电泳(T=6%,C=3.3%,凝胶规格为82mm×64mm×0.75mm)。电极缓冲液为1×TBE。将加有1/5体积上样缓冲液的酶切产物
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以下是一般的PCR-SSP操作步骤:
1.提取DNA样本。
2.混合PCR反应体系,包括DNA模板、引物、dNTPs、聚合酶和配制的PCR缓冲液。
3.进行PCR反应,通常包括冷却、扩增、再热和再冷却等循环。
4.添加单链配对剂,以形成单链DNA。
5.进行SSP分析,通常包括将反应物和SSP试剂盒中的单链配对剂混合,然后进行电泳分析。
6.解释SSP结果,以鉴定DNA样本中的特定基因多态性。
注意:上述步骤可能根据所使用的PCR-SSP试剂盒和设备有所变化。
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