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引物设计时,GC含量过低提高不上去怎么办

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小崔正在努力

这个基因的ORF全长是2337bp 起始密码子从3th 的位置开始 这就导致我在设计引物时上游的GC含量提不上去 下游可以提高 但是上下游的GC含量相差太大怎么办

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4 个回答

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bamboopiggy

有帮助

你可以考虑酶切位点以及保护碱基里面多加几个GC就好啊。

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你好几和户

有帮助

一般GC含量低的话把引物序列设计稍微长一点,就可以补偿Tm低的问题.你说的百分比差别也不是那么大.如果两个引物的tm不同,按照低的考虑PCR的退火温度.加酶切位点的引物的Tm需要按照不包含酶切位点的序列计算.GC含量最好在50%以上比较好,不然退火温度达不到,建议重新设计引物,试试梯度PCR的策略.

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汤姆卜丽波

有帮助

可以在后面加一小段高GC的序列不影响特异性识别和结合

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秋秋欣欣

有帮助

引物足够长时,即使GC含量稍微有点低也没有关系

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