求问大佬，miRwalk数据库预测miRNA和靶基因结果怎么样，可靠性大吗？

miRwak数据库对miRNA靶基因的预测有一定参考价值,但预测结果的可靠性尚有限生物验证是最终确认mRNA靶基因关系最重要的手段。miRwalk的预测结果只能作为miRNA靶基因研究的起点需要进一步设计实验进行验证方可得出更加准确和令人信服的结论。

miRwalk数据库是比较常用的miRNA靶基因预测数据库之一。它整合多种miRNA靶基因预测算法的结果,旨在提高预测的可靠性。然而,miRNA靶基因预测本身存在较大不确定性,miRwalk的预测结果也需谨慎解释:

1. miRwalk综合多种算法结果,但不同算法准确性不同。miRwalk无法去除所有的假阳性预测,仍会出现一定比例的错误预测结果。

2. 目前已知一个miRNA可调控多个靶基因,而一个靶基因也可以被多个miRNA共同调控。miRwalk无法考虑所有复杂的miRNA-靶基因调控网络,预测结果存在局限性。

3. miRwalk预测大多基于miRNA和靶基因之间的互补配对和进化保守性,忽略了诸如蛋白质翻译后调控等机制。实际上,miRNA和靶基因间的关系远比互补配对复杂的多。

4. miRwalk所用数据集和算法训练过程中包含的样本量有限,许多 miRNA-靶基因调控关系尚未被发现。预测结果难以涵盖所有的miRNA靶关系。

5. 生物学验证是验证miRNA靶基因预测结果最为准确的方法。miRwalk的很多预测结果仍需生物验证后才能确认。

综上,miRwalk数据库对miRNA靶基因的预测有一定参考价值,但预测结果的可靠性尚有限,生物验证是最终确认miRNA靶基因关系最重要的手段。miRwalk的预测结果只能作为miRNA靶基因研究的起点,需要进一步设计实验进行验证,方可得出更加准确和令人信服的结论。

miRWalk是一个综合性的miRNA靶基因数据库，收录了人、小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息，和mirDIP类似，是一个整合型数据库，整合了来自miRDB，TargetScan,miRTarBase等数据库中的信息，所以用其预测miRNA和靶基因结果是可靠的。