远方_oe7m
参考文献中的方法对样本进行代谢物提取,文献中方法如下:
取样品30mg放入1.5mlEP管→加入两个4mm钢球→加入20μL内标→加入600μL甲醇:水(4:1)→-80℃,放置2min→60HZ超声2min→加入120μL MTBE→剧烈涡旋→环境温度下超声提取10min→4℃放置10min→4℃,13310g离心10min→取上清,冻干→衍生化
其中有加入MTBE进行提取,这个提取之后的代谢物是不是大部分都是脂质?这个提取方法是不是主要关注的物质是脂质?我做非靶向检测的话这个方法合适吗?
毛利小五郎的徒弟
这个提取方法的产物大部分都是脂质。
huarenqiang5
加入MTBE提取样本时,提取溶剂会分为两相,一相中含有非极性代谢物(如脂质),另一相中包含极性代谢物。在任何一种两相溶剂提取方法中都会存在一个问题,就是一些跟基质有关的中等极性的代谢物将会被分别溶解入亲脂性溶剂和亲水性溶剂中,而在每一相中溶解的比例会受到基质组成的影响。举一个简单的离子说明以下,受试者空腹和餐后血液中的甘油三酯含量差异会很大,这种差异可能会使两亲性化合物从亲脂相溶剂转移入亲水相溶剂。
但是如果在一个实验中,待测样本的基质组成没有很大偏差的话,建议针对某一类基质进行方法优化,如优化复溶溶剂或复溶的混合溶剂,以及LC-MS的条件等来扩大检测到的代谢物的覆盖面。如果没有内标化合物去校正基质效应的话,对其进行系统地评价会变得很复杂。如果想要排除基质的干扰的话,将亲脂性和亲水性代谢物同时检测将会大大提高检测到代谢物的数量及其检测的覆盖面。
使用高效液相色谱小瓶的内插管来对样品进行两相溶剂提提取,通过离心使提取溶剂分层,上层为非极性代谢物,下层为极性代谢物,在不对二者进行进一步分离的情况下,通过调节LC-MS进样针的位置来分别对上层和下层提取物进行检测。需要注意的是,当使用MTBE作为提取溶剂时,如果需要重复进样,需要快速操作,因为相比其他溶剂,MTBE非常容易挥发。在此方法中,两亲性的酰基肉碱类化合物在两相溶剂提取液中都可以检测到:在MTBE/甲醇/水提取系统中,短链(2-10个碳)酰基肉碱类化合物主要存在极性溶剂中,而长链(12-20个碳)酰基肉碱类化合物则主要出现在非极性溶剂相中。
为了可以在一次LC-MS进样中同时分析锻炼和长链酰基肉碱类化合物,有研究者将提取液的上层非极性化合物和下层极性化合物以体积比2:1的比例混合,之后挥干溶剂,复溶之后进行LC-MS分析。
一般来说,两相溶剂提取样本之后,对两相提取物分别用LC-MS进行检测可以显著地提高代谢组学和脂质组学的检测覆盖面。对于一些常用的样本如血液、动物组织等来说,亲脂相溶剂中通常含有不同的脂类成分,覆盖了从长链酰基肉碱类化合物和磷脂类化合物到酰基甘油和胆固醇酯类化合物;而亲水相溶剂中则包含有亲水性的脂类化合物如短链酰基肉碱类化合物以及其他亲水性代谢物(如:氨基酸、有机酸等)。
loveliufudan
如果您打算进行非靶向检测,即对样品中所有代谢物进行广泛的分析和检测,这个方法可能并不完全适合。由于MTBE的选择性,它在提取过程中可能优先提取脂质代谢物,而对其他代谢物的提取效果可能有限。这意味着您可能会错过其他非脂质类代谢物的检测,从而限制了您对样品整体代谢组的了解。
对于非靶向代谢组学研究,通常会使用多种提取方法或萃取剂,以确保对不同类型的代谢物都有较好的提取效果。您可以考虑综合使用其他提取方法,例如水提取、酸性提取、有机溶剂提取等,以获取更全面的代谢物信息。