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非靶向代谢组学实验中仪器的选择

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远方_oe7m

在非靶向代谢组学研究的文献中有的用的仪器是UPLC–Q-TOF/MS ,有的是UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/MS  我想做非靶向代谢组学检测,但是仪器有很多中不知道怎么选,区别在哪里?

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4 个回答

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dxy_mqg1dtg8

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UPLC-Q-TOF/MS和UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/MS都是常用的非靶向代谢组学检测仪器,它们之间的主要区别在于分离柱、检测器和质谱分析器的不同。具体如下:

1. 分离柱:UPLC采用超高效液相色谱柱(Ultra Performance Liquid Chromatography),其粒径和长度均比传统的高效液相色谱柱(HPLC)小,因此分离能力更强,分离效率更高。而UHPLC则是更加高级的超高效液相色谱柱,粒径和长度都比UPLC更小,因此分离能力和分离效率更高。

2. 检测器:UPLC和UHPLC通常采用同一种类型的检测器,即二极管阵列检测器(Diode Array Detector,DAD),用于检测样品中的各种化合物。DAD可以测定样品中的UV吸收光谱,因此可以在UV波长下确定样品中化合物的类型和浓度。

3. 质谱分析器:UPLC-Q-TOF/MS采用四极杆时间飞行质谱仪(Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry),而UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/MS则采用Q-Exactive Orbitrap MS/MS质谱仪。两者的主要区别在于Q-Exactive Orbitrap MS/MS具有更高的分辨率和质谱精度,因此能够更准确地鉴定样品中的化合物和分析复杂的代谢组学数据。

 

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沫子大大

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它们之间的区别主要在于以下几个方面:
色谱柱:UPLC使用直径较小的柱子,通常为1.7-2.5 μm,比传统的HPLC柱子直径小很多,因此可以实现更高的分离效率和分析速度。而UHPLC则使用更细的柱子,通常为1.8 μm或更细,可以进一步提高分离效率和分析速度。

质谱分析器:Q-TOF和Q-Exactive Orbitrap都是高分辨质谱仪,但其原理略有不同。Q-TOF采用时间飞行质谱分析器,可以实现高灵敏度、高精度和高分辨率的质谱分析,但其分析速度相对较慢。而Q-Exactive Orbitrap则采用轨道阱质谱分析器,具有更高的分辨率和灵敏度,同时可以实现更快的分析速度。

数据处理软件:因为不同的仪器采集到的数据格式和质量不同,所使用的数据处理软件也可能不同。例如,UPLC–Q-TOF/MS常用MassLynx软件进行数据处理,而UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/MS则常用Thermo Xcalibur或Proteowizard软件进行数据处理。

在选择仪器时,需要考虑到实验要求、实验预算和实验室设备等方面的因素。如果实验预算充足,且需要高分辨率和高灵敏度的分析结果,那么UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/MS可能更适合。而如果实验预算有限,且需要较高的分辨率和灵敏度,同时可以承受较长的分析时间,那么UPLC–Q-TOF/MS可能更为合适。此外,还需要根据实验需要选择合适的色谱柱和数据处理软件。

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loveliufudan

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UPLC-Q-TOF/MS和UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/Ms是常用于非靶向代谢组学研究的仪器。它们在技术特点和性能上有一些区别。

UPLC-Q-TOF/MS代表超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱仪(Ultra Performance Liquid Chromatography-Quadrupole-Time of Flight/Mass Spectrometry)。这种仪器具有高分辨率、高灵敏度和高质量的质谱数据,并且能够提供较好的代谢物定性和定量分析能力。它通常用于代谢物的发现和初步鉴定。

UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/Ms代表超高效液相色谱-Quadrupole-Exactive Orbitrap串联质谱仪。与UPLC-Q-TOF/MS相比,它采用了Orbitrap质谱检测器,具有更高的分辨率和质量准确度。这种仪器通常用于代谢物的鉴定和结构确认,以及更准确的代谢物定量分析。

选择合适的仪器取决于你的研究目的、预算和实验需求。如果你主要关注代谢物的初步发现和定性分析,UPLC-Q-TOF/MS是一个不错的选择。而如果你需要更高的分辨率、质量准确度和结构确认能力,以及更精确的代谢物定量分析,UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/Ms可能更适合你的研究。

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土井挞克树

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这个主要看你实验室的仪器配置,两者没有太大差异

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