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分离病毒WB能够检测到病毒蛋白的条带,但为什么基因组始终检测不到?

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dxy_yewk4jc7

换了两种病毒蛋白的一抗,始终能检测到条带。细胞也有病变,并且从出现病变那代开始,细胞病变也较为稳定,但全基因组测序以及跑WB的相应蛋白的基因序列也未能扩处,这种是什么情况啊?

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3 个回答

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

可能是基因含量过小,比如片段kb小就不容易检测到

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dxy_yewk4jc7user-title

病毒滴度还可以的,不算很低

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sswei

有帮助

存在以下因素:1 可能是因为序列太长吧,2 可能由于二级结构复杂。

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dxy_yewk4jc7user-title

之前检了小片段的也没有测出来

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loveliufudan

有帮助

出现这种情况的可能原因很多,以下是一些可能的解释:

病毒基因组存在变异:病毒基因组发生变异可以导致一些区域不被扩增或检测不到。这可能是全基因组测序和相应蛋白的基因序列未能扩出的原因。

病毒基因组集成到细胞染色体中:有些病毒可能将其基因组集成到细胞染色体中,这种情况下,全基因组测序可能无法检测到病毒基因组。

病毒可能是一个RNA病毒:如果病毒是一个RNA病毒,可能需要使用特殊的技术来扩增和检测其基因组。

限制性酶位点缺失:病毒基因组中的限制性酶位点缺失可能导致基因组难以被扩增或测序。

病毒感染量较低:病毒感染量较低也可能导致基因组难以被扩增或测序。

需要进一步的实验和检测来确定原因,如尝试使用其他技术来检测病毒基因组、检测病毒感染量、进行基因组比对等等。

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dxy_yewk4jc7user-title

我们这个病毒确实是个RNA病毒,F1-F2的基因组一直是能够扩增出来的,其实一直怀疑是不是其他的病毒,但是该动物易感相关的病毒又都检测了没有。

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