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这是之前问的一个问题,由于丁香平台不能回复,还请各位大佬看一下下面的图文

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老陈味

上面两位老师的回答是有点难度的,因为物种不一样或者即使物种相近的话,序列的同源性也是不高的,不可能一个一个序列拿出来比对。而且序列比对的话是后一步的工作(就是找出我们所研究的这株菌对应的序列与其他物种的序列比对找出它们的保守序列),所以有没有大佬有相关经验啊?

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1 个回答

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Eason老歌迷

有帮助

我还是觉得一楼那个方法可行,查找相关酶的序列,和你的目标酵母菌序列进行对比。或者我在教你一个方法。你就用ncbi,打开NCBI,用关键词在Taxonomy数据库搜索。得出它的拉丁文,并且有一个问题需注意,酵母菌下还是有一些种的。

知道了酵母菌的txid,就很容易了。一搜就出来了。

上面已经定位到了酵母菌下的所有蛋白的基因了。上面如果要找核酸的,把数据库选择为Nucleotide就行了。接下来就是定位到基因某个基因了。

最后就是靠自己判断了,看看序列注释信息。

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