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RNA干扰试验提取RNA需要注意什么?
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① 使用无 RNase 的塑料制品和枪头,玻璃器皿要消毒,避免交叉污染;使用性能较好的移液器,如 Eppendorf、Thermo 等;
② DEPC 有剧毒,小心配制;配制溶液应使用无 RNase 的水;
③ 操作人员应戴一次性口罩和手套,实验过程中要勤换手套;
④ 样品应避免反复冻融,否则影响提取 RNA 提取得率和质量;
⑤ 若下游实验对 DNA 非常敏感,可用不含 RNase 的 DNase I 对 RNA 进行处理。
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1. 避免使用抗生素
Ambion公司推荐从细胞种植到转染后72小时期间避免使用抗生素。抗生素会在穿透的细胞中积累毒素。有些细胞和转染试剂在siRNA转染时需要无血清的条件。这种情况下,可同时用正常培养基和无血清培养基做对比实验,以得到最佳转染效果。
2. 选择合适的转染试剂
针对siRNA制备方法以及靶细胞类型的不同,选择好的转染试剂和优化的操作对siRNA实验的成功至关重要。
3. 通过合适的阳性对照优化转染和检测条件
对大多数细胞,看家基因是较好的阳性对照。将不同浓度的阳性对照的siRNA转入靶细胞(同样适合实验靶siRNA),转染48小时后统计对照蛋白或mRNA相对于未转染细胞的降低水平。过多的siRNA将导致细胞毒性以至死亡。
4. 通过标记siRNA来优化实验
荧光标记的siRNA能用来分析siRNA稳定性和转染效率。标记的siRNA还可用作siRNA胞内定位及双标记实验(配合标记抗体)来追踪转染过程中导入了siRNA的细胞,将转染与靶蛋白表达的下调结合起来
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