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RNA干扰提取RNA注意事项?

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highhill2000

RNA干扰试验提取RNA需要注意什么?

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3 个回答

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迟C迟

有帮助

① 使用无 RNase 的塑料制品和枪头,玻璃器皿要消毒,避免交叉污染;使用性能较好的移液器,如 Eppendorf、Thermo 等;

② DEPC 有剧毒,小心配制;配制溶液应使用无 RNase 的水;

③ 操作人员应戴一次性口罩和手套,实验过程中要勤换手套;

④ 样品应避免反复冻融,否则影响提取 RNA 提取得率和质量;

⑤ 若下游实验对 DNA 非常敏感,可用不含 RNase 的 DNase I 对 RNA 进行处理。

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府宅

有帮助

1. 避免使用抗生素

Ambion公司推荐从细胞种植到转染后72小时期间避免使用抗生素。抗生素会在穿透的细胞中积累毒素。有些细胞和转染试剂在siRNA转染时需要无血清的条件。这种情况下,可同时用正常培养基和无血清培养基做对比实验,以得到最佳转染效果。

2. 选择合适的转染试剂

针对siRNA制备方法以及靶细胞类型的不同,选择好的转染试剂和优化的操作对siRNA实验的成功至关重要。

3. 通过合适的阳性对照优化转染和检测条件

对大多数细胞,看家基因是较好的阳性对照。将不同浓度的阳性对照的siRNA转入靶细胞(同样适合实验靶siRNA),转染48小时后统计对照蛋白或mRNA相对于未转染细胞的降低水平。过多的siRNA将导致细胞毒性以至死亡。

4. 通过标记siRNA来优化实验

荧光标记的siRNA能用来分析siRNA稳定性和转染效率。标记的siRNA还可用作siRNA胞内定位及双标记实验(配合标记抗体)来追踪转染过程中导入了siRNA的细胞,将转染与靶蛋白表达的下调结合起来

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dxy_gwrp7ndq

有帮助
1. 纯化siRNA

在转染前要确认siRNA的大小和纯度。为得到高纯度的siRNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。

2. 避免RNA酶污染

微量的RNA酶将导致siRNA实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮肤,头发,所有徒手接触过的物品或暴露在空气中的物品等,此保证实验每个步骤不受RNA酶污染非常重要。

3. 健康的细胞培养物和严格的操作确保转染的重复性

通常,健康的细胞转染效率较高。此外,较低的传代数能确保每次实验所用细胞的稳定性。为了优化实验,推荐用50代以下的转染细胞,否则细胞转染效率会随时间明显下降。
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