怎么设计实验用CO-IP（CO-Immunoprecipitation）验证两个蛋白是否互作呢？

最基本的方法是用ip级别的抗体钓取一个蛋白，跑wb检测是否钓取的蛋白中是否有另外一个蛋白的存在。如果没有ip级别的抗体，则需要在细胞系中共表达两个蛋白，使得其中一个带tag（例如his，ha，flag等），使用抗tag的抗体钓蛋白，检测另一个蛋白，从而验证蛋白是否互作

当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质相互作用被保留了下来，假如细胞内存在XY蛋白复合物，用X（X也称为诱饵蛋白）的抗体免疫沉淀X，那么与X在体内结合的蛋白质Y（Y也称为靶蛋白）也被沉淀下来。因此在细胞裂解液中加入X的抗体沉淀蛋白X，随后利用蛋白印迹（western blot，WB）检测沉淀中是否存在蛋白Y，如果存在，则说明细胞内存在XY蛋白复合物，即蛋白XY存在相互作用。