有这样一位博士，在医学部校园待了十年，毕业离校的时候想学泰戈尔留下一些痕迹，以纪念这一段苦逼的岁月。他做到了，曾经他历时 728 天制作了视频，现在他将这些视频汇总在一起，定做了优盘，于是有了这个纪念版的《科研四部曲》。张浩然博士简介张浩然，1990 出生，北京大学博士生。网络视频《科研实用电脑技巧四部曲》的作者，视频创作于他博三和博四期间，即 2012 年 9 月 9日--2014 年 9 月 6 日。科研四部曲《科研实用电脑技巧四部曲》，简称《科研四部曲》，主要介绍一些适合科研工作者的实用电脑技巧及相关软件。旨在提高电脑前的工作效率，制作高质量的电子作品。由以下4个视频系列组成： • 科研论文作图，共20集，11小时57分钟 • 大学电脑技巧 共10集 6小时14分钟 • 科研数据处理 共20集 12小时24分钟 • 科研示意图 共10集 5小时13分钟最适合的读者：拥有一定电脑基础，期待与电脑进行更高效、更默契的配合，主要从事科研行业的大学生、研究生、工作人员和教师等。U 盘纪念版版与免费共享版《科研四部曲》有两个版本，U 盘纪念版与免费共享版有一些不同，具体如下。其中 U 盘纪

当个科学家是许多理工科学生儿时的美好梦想，但《nature》杂志的一项调查可能让你大跌眼镜。科学家原来是一个非常辛苦，赚钱又少的职业。假如一个理工科的学术硕士毕业或者博士毕业选择去公司工作，而不是继续从事科研，那么他们的收入可能很高，而且不是一般的高。高收入带来的不仅是经济上的独立，更是情感上的慰藉。40% 的学术界受访者对薪酬满意超过三分之二( 68% )的受访者表示对自己的职业感到满意或非常满意，这一比例与 2016 年的调查结果基本持平。相比之下，只有 40% 的学术界受访者对自己的薪酬感到满意，远低于平均水平。然而，令人好奇的是，来自中国的受访者普遍（75%）表示对目前的工作十分满意。这个满意度是非常高的，但事实好像并非如此。△ 图片来源：Nature，数据来源因为在中国，普通的科研工作者如博士和博士后的待遇是非常低的。那些被调查者应该都是高校的教授，因为国内能够花几百美元订阅 Nature 杂志的，也只有高校教授了，所以这个群体应该有比较高的满意度。如果把博士和博士后纳入调查范围，相信这个满意度将会下降很多。博士后是低收入群体的典型代表有 35% 的人工资超过 5 万美元，2

每当要搞从未做过的实验时，总会抓狂，到哪找 Protocol 呢？别急，下面让我们一起开启寻找 protocol 之旅。一.搜索引擎不过多解释，想要在网上找东西，就靠 Google。在此给出一点建议：多用 Google.com，多搜英文关键词。推荐搜索引擎：Google.com, Bing.com二.权威 Protocol 网站网上有许多专门以 protocol 为主的网站，现举例最有名的：1. Nature Protocol重点推荐「Discussion Forum」「Tools & Reagents」「Featured Movies」专区。有讨论组，有常用试剂配方，还有特色的实验视频，强烈推荐。2. Cold Spring Harbor Protocols3. Springer ProtocolsSpringer Protocol 最大的优势，就是可以在线管理属于自己的 Protocol，而且其中很多实验方法，多来自经典实验参考书 Methods 系列。三.生物 / 医学实验视频JoVE 全称 Journal of Visualized Experiments，该网站是专门

作为生物医药领域的本科生、硕士生或者博士生，大家基本都学习过医学统计学，有人还重复学过两三遍。但到了自己独立处理数据时，仍茫然不知所措，有时甚至连该选啥统计方法都不确定，这究竟是为什么呢？统计是一门实实在在的应用工具科学，不实际使用，一切都是白搭。而应用之初，必须要能够选择正确的统计分析方法，这恰恰也是很多统计学习人士的死穴。统计学习也许没有捷径，但肯定有更优效的方法。丁香公开课特邀国家高级统计分析师、大学副教授松哥为大家带来《 SPSS 中级统计实战教程》，让你真正摆脱学统计时「为伊消得人憔悴，一用就错学不会」的困境。这门课是松哥经过 18 载医学统计学讲授经验的提炼，没有复杂的公式或难懂的理论，只有形象的比喻和简单的说明。例如，松哥将医学统计方法的选择变成了朗朗上口的 15 字口诀（方法看变量、设计看类型、目的定乾坤），让你轻松 5 秒内正确选择统计分析方法。本课程适合从零基础到进阶的学员，全部使用 SPSS 23.0 进行软件操作和实战案例教学，让学员快速掌握统计分析方法的正确选择和 SPSS 软件的实际操作，即学即用！

国内讲师？国外博士后？公司上班？应该是很多刚刚毕业两年左右的博士需要思考的问题。此时的特点是科研经历还不够多、科研成果还有待增加，但是，这个阶段的人属于非常富有想法、激情、时间的人群，也都希望能够有更好的发展空间。应该说，国内讲师职位和国外博士后岗位，两个职位的吸引力是差不多的，当一个人同时获得两个岗位时，到底如何选择，或许会走出两条完全不一样的人生。国内讲师的机会1.国内好一点的 985 大学的讲师，都可以担任硕士研究生导师，有些还能够成为博士生导师。也因此，如果运气很好，一年能够招聘到两个学生，这样的话，就有机会学习如何建设、管理团队。2.担任讲师期间可以申请一些科研项目，比如每一个省都有省级自然科学基金、教育部新教师基金、国家自然科学基金青年基金。3.讲师期间做出的成绩可以算作自己独立科研做出的成果。4.有机会晋升职称。如果一个讲师做的不错，那他是能够很快地成为副教授，或者更快地成为教授。国外博士后的机会1.国外博士后，可以一门心思地做科研。博士毕业几年是出成果的黄金年龄，如果有一个地方能够找一个地方修身养性，多出一些成绩，将来的学术生涯还是会辉煌很多的。2.国外博士后，也可以申

大家在实验过程中，是不是经常会用到各种染色法？但是染色方法如此之多，其具体方法与步骤又有什么区别？学霸君非常的贴心，帮大家整理了各种染色方法，并作了汇总。以下是从 A 至 V 的染色大法一览表

好论文更需好配图。今天为大家例解一款简单粗暴却能绘出高端大气上档次的科研示意图软件——Inkscape。废话不说，先奉上要临摹的原图：☞ http://atvb.ahajournals.org/content/25/5/904下面就开始用 Inkscape 把它简单粗暴的弄出来。1. 打开软件，利用【贝塞尔曲线】和【圆圈】工具大致确定图像比例位置。2. 画出基本细胞轮廓（F2 逐点编辑），右键对「颜色和填充」属性进行修改，利用渐变编辑高光。3. 复制细胞轮廓，修改「填充」、「笔廓」、「模糊」等属性做出阴影。按 Shift 同时选中细胞、核、阴影，「群组」为一个单位。哈哈，然后就不停的 copy-paste。4. 学会前面的技巧，画单核巨噬——PIECE OF CAKE。5. 画出方框和圆，通过求「差集」「并集」得到 SR 受体轮廓，再用【F2 节点编辑】进一步修正，将其缩小后移至靶点。「视图」可显示网格。6. 不规则的细胞都画完了，球型的 LDL 无须废话，控制好渐变即可。用【铅笔工具】画出箭头的线条，并通过「笔廓风格」栏加上箭头。7. 添加文字。通过「文件—文档」属性调节页面大小。8

实验室常见靶基因表达水平检测方法主要集中于在基因转录前调控、转录水平和转录后 mRNA 加工及修饰等过程，合成后靶蛋白质也存在修饰。成熟 mRNA 翻译指导蛋白质合成量分析有多种检测手段，其中最经典和广泛为业界认可是蛋白质免疫印迹杂交实验（Western blotting）,也是论文中最常见的数据呈现形式。 蛋白质免疫印迹杂交实验原理是将已分离的总蛋白在 β 巯基乙醇等存在时，高温破坏其三维空间结构充分暴露出抗原结合位点，使针对靶蛋白的抗体能与其结合，再与带有显色标记物（酶）二抗结合，最终根据显色底物显色深浅判断靶基因蛋白的表达量。其检测过程（步骤）如下： 显然,免疫印迹杂交试验步骤多，包含多个影响实验结果因素，如 SDS-PAGE 胶浓度、合适甲醇配比转膜缓冲液、一抗来源及其特异性等，而对结果影响较为显著的步骤是蛋白样品的提取与处理，SDS-PAGE 浓度对蛋白分离效果，转膜条件和一抗抗体选取和孵育条件等。本文主要通过比较实验，探讨后三个步骤对结果的影响。（一）SDS-PAGE对蛋白分离 同 PCR 实验中琼脂糖浓度对不同长度 DNA 区分度

一个上进的科研汪放暑假应该做什么，当然是，留校做实验啦！毕竟一如实验深似海，从此假期是路人。暑假时间长，没有课程打扰，是做实验的黄金时间，尤其对于想争取奖学金、毕业压力大，急于发表文章的小伙伴。想要好结果需要多做多试，但实验室用品有限，能不能能用很少的经费就能搞到大牌实验产品呢？办法当然有啦！有求必应的学霸君今天今为大家带来了几款优选试剂耗材，现价全部 19.9 封顶！对比原价能省下多少经费，你懂的。所以看中了就赶快抢，别忘了把信息填写完整，这样能抢的更快，抢的更多哦~贴心提示：夏天温度高，湿度大，各位小伙伴们辛苦做实验的同时，一定记得按照规范操作和保存实验用品，注重实验室通风和安全哦~1 Wshtbio 蛋白电泳预制胶这是一款美国 EZBiolab 公司开发高性能超低成本聚丙烯酰胺预制凝胶，专利凝胶和缓冲液配方，分辨率高，条带清晰，电泳效果极佳。胶夹打开轻松，电泳时间短，40-50 分钟即可完成。兼容市场上主流的 mini 电泳槽， 凝胶中不含 SDS，可用于变性及非变性电泳。2 NCM Biotech 无血清细胞冻存液CELLSAVING® 是一种即用型无血清细胞冻存液，通用于各

经常看到很多大牛的 PPT 里面有很多极具视觉性的 Animation，自己平时也看到很多生物医学相关的国外的 Video，但是以上两种大多只能在线观看，不能下载（若知道下载方法的请忽略此文），经过探索及使用，现将相关下载方法推荐给各位，希望对需要的人有用。01 推荐的国外生物学视频网站1. BioInteractiveBioInteractive2. PBS Learning MediaPBS LearningMedia以上两个网站都包含了大量生物学相关的 Animation, Video, Lecture 等。02 推荐国外医学视频网站1. Web MDWebMED这个网站在国外都非常普及，包含大量的医学内容，如医学视频、图谱、治疗方法等。03 如何下载视频？以上仅仅自己经常使用的网站，也可在其它网站找到相关视频，但都面临如何下载的问题，这里主要介绍两种下载方法。1. 最简单的办法：打开网页 savefrom。只需要将所要下载的视频链接复制到此检索框，justinsert a link，即可下载。savefrom很多视频都可通过该方法下载，如果不能下载，可通过以下方法下载。2. 通

松哥常说：初级说一说；中级比一比；高级找关系。t检验是中级比一比最最常用和基础的方法。可是基础归基础，不代表你就能搞定。某人咨询「松哥，SPSS 很简单，我买了书，看了后，感觉差不多都会了，可是自己独立处理两独立t的时候，SPSS 频频报错，太打击我啦！」哈哈，统计学习如果看书都能搞定，那还要松哥干什么！统计学习首先要懂统计理论，其次再谈统计软件学习，理论不必深，掌握统计思想就行；统计软件的学习是在统计理论的指导之下。所谓的教科书，告诉你的都是标准化的数据，你用他书中的案例数据跑，那绝对是没问题，可那些都是编书的案例数据，离我们真实数据相差几个十万八千里。遇到真实数据，你会遇到一系列让你粉身碎骨的坑，此时，你需要一个师傅、一个老司机，传授你经验，渡你到彼岸！所以，松哥认为，统计学习看文字书不如看图文并茂的书；看书不如看视频！好了，我们看看这位遇到啥问题了！问题展示当这位咨询者，直接将如下截图发到我微信的时候，我都懵了，啥情况这是，我说你把数据发过来吧，于是！他是这样做的他是做两组白细胞比较，观察组和对照组，数据如图，考虑隐私展示一点点。分析结果一切正常呀，难道是他的软件问题，不会呀，我

对于做肿瘤研究的科技工作者来说，肿瘤基因芯片数据库的熟练使用已成为必备的技能。TCGA 是目前最大的癌症基因信息的数据库，然而并不提供相关分析，这对于小白来说有点麻烦了。相比之下，Oncomine（目前世界上最大的癌基因芯片数据库和整合数据挖掘平台）就要友好多了。其相对简单的操作，相信大家一定有所了解了；然而，Oncomine 并不提供免费的午餐——在用学术邮箱注册登陆后仍然有诸多限制。其中，最大的限制是不能下载数据。什么？好不容易找到一个满意的数据，不能下载原始数据？也不能保存可编辑图片！你能做的只能截个图了… …（然后你就在纠结用 QQ 还是搜狗截屏像素更好了吧？一脸斜线…）于是网上就有了如何用 photoshop 或 illustrator 描图的教程了… 再次满脸斜线… （如果想统计差异怎么办？）基于以上原因，特写以下教程分享给大家。原汁原创，全网首发。欧耶~ 下面上干货！1 在找到满意的数据后，先选择以 bar 图显示；再在图表上右键选择审查元素（如下图，英文版浏览器选择 Inspect，建议使用 chrome 内核浏览器）；2 然后，再次在图表上右键选择审查元素即可自动跳到

FlowJo 是美国斯坦福大学 Leonard Herzenberg 实验室研发的一款流式数据分析软件，它可以对所有流式细胞仪产生的数据进行分析，在多种电脑操作系统上兼容性良好。由于功能强大，简单易用，已经被生命科学领域内的科学家、实验室广泛使用；同时 FlowJo 也是各高影响力核心期刊最受欢迎的流式数据分析软件。本文主要针对流式分析中常用的平均荧光强度 (MFI)，五个小步骤带你快速分析出 MFI。01 打开 FloJo，显示工作台。02 找到原始数据（fcs 格式文件）Ctrl+A 将所有文件全选，鼠标将其直接拖到 All Samples 中，如图：03 针对数据一进行分析1、鼠标左键点击 fcs 格式数据出现流式散点图，X 轴默认选择 SSC（侧向散射，其散射强度与细胞内颗粒结构的质量正相关，即细胞内颗粒结构越复杂，质量越大，SSC 越大；反之越小）。Y 轴默认选择 FSC（前向散射，该值与细胞的直径正相关，即细胞越大，FSC 越大；反之越小）。2、圈门：根据实验目的选择合适的圈门工具（矩形门、十字门、椭圆门、多边形门）进行圈门，圈出需要进行分析的细胞后点 OK 确认。圈出的细

在自己拥有一个或者更多基因组的情况下，如何在这些基因组中找到自己想要的功能基因，这对于基因组分析来说，比较重要。而利用测序公司给我的功能注释结果，由于所用的注释的数据库的老旧等原因，往往在注释结果是很不准确的, 在很多实验室中公司给的功能注释结果都是不会用的。本地比对对于基因组基因功能分析来说显得尤为重要。对于本地比对，首先是要在 NCBI 下载本队比对软件 blast，下载在这里就不多说，下载好就需要进行安装了，win 安装步骤如下：安装流程：双击安装到 C:Blast，生成 bin 和 doc 两个子目录，其中 bin 是程序目录，doc 是文档目录，这样就安装完成，同时需要另建一个 db 文件。用户环境变量设置：右键点击「我的电脑」- 属性，然后「高级系统设置」选项 -「环境变量」，在用户变量下方点击「新建」- 变量名：BLASTDB，变量值：C:Blastdb（即数据库路径）。在系统变量下方「Path」添加变量值：C:Blastin。最后在你的电脑 C 盘就有一个 blast 的文件夹，里面包括 bin、db 以及 doc 三个子目录，如下：安装好后就是对你的自己序列的处理了。

大多医生接触的医学事务人员，多数是医学沟通顾问或医学联络官（下文统一用 MSL 代替）了，这也导致想从医院跳槽出来的医生，第一个想到的就是，要不我也去做 MSL 试试？就像很多患者只了解医生在门诊的工作状态一样，MSL 在医院和医生实际接触，也只是工作的其中一部分。在决定是否跳槽之前，最好能对这项工作有一个全方位的认识，不求深入，但要全面。MSL 的发展前景如何？对于希望跳出医院，同时又在医疗领域发展的年轻医生朋友，MSL 是一个不错的入门选择。不管是医学事务部门内部的MSL——MA/MSL、Medical head/director这样的发展路线，还是转到销售或市场部门担任其他岗位，作为在企业工作的起点，MSL 都能提供非常全面的视角。毕竟，除了外部客户以外，MSL 还要和公司内部几乎所有的部门打交道，这一方面会考验一个人的沟通与协调能力，一方面也能让一个职场新丁迅速的了解企业运作的方方面面。同时，未来的医疗企业，不管哪一个部门，都会要求员工有更强的医学能力和专业素养，MSL 这个岗位，恰恰可以提供这方面的锻炼和学习。MSL 的工作状态是怎样的？两个主要因素决定一个 MSL 工作状态

关于数据挖掘发表文章，我们知道很多人是看不上、瞧不起、嗤之以鼻的。大抵是因为这些人平时只发 CNS 主刊，所以才认为通过数据挖掘这种用「别人的数据」或者叫「干实验」来发文章是「垃圾」，没有什么价值。真的是这样吗？今天我们要介绍的就是一篇做数据挖掘的 Cancer Cell 杂志的文章（IF: 27.4），大家来看看文章怎么样。1 文章数据挖掘的情况肿瘤类型：妇科肿瘤和乳腺癌；数据来源：主要是 TCGA 数据库，1,087 例 BRCA（invasive breast carcinoma，乳腺癌）, 308 例 CESC (cervical squamous cell carcinoma and endocervical adenocarcinoma, 宫颈癌 ), 579 例 OV（high-grade serous ovarian cystadenocarcinoma，卵巢癌）， 548 例 UCEC（uterine corpus endometrial carcinoma，子宫内膜子宫内膜癌）和 57 例 UCS（uterine carcinosarcoma ，子宫癌肉瘤），共 2

作为医生，除了繁忙的临床工作外，每年总有那么几个月被标书弄得生无可恋，不要说新手，就是老司机也照样心烦气燥。对于初学者，平时看了大（You）量（Xian）的文献。但在写标书的研究背景与现状时，经常会发现记不起来一句话、一个结论、一段描述在哪篇文献里提到过。关键词倒是记得，但茫茫文献大海，需要的那篇在哪里？如果你从一开始就学会用 EndNote（以下简称 EN）来管理文献，写标书时就 so easy。下面来讲讲初学者如何利用 EN 来智能管理你的文献库。老话说得好，良好的习惯，成功的一半。EndNote 如何安装、基础使用和相关的注意事项，请参考生物学霸以前的文章。首先建立一个自己的库，一定注意保管好，因为你这辈子的 Paper 和 idea 都会从这个库里产生。没事多做备份，因为系统有时候会损坏库文件。第一步，如果你还没有明确的 idea，那么看过的文献就让在总库里。如果你已经有了一个明确的研究点，请务必建立一个相关目录，将所有你看过的相关文献都拉到这个目录下（图 1）。△ 图一如此操作，下次在写标书时，就会非常方便，可以大大缩小寻找指定文献的范围。但是还不够，具体到哪一篇，还得精确搜

养细胞是一件戳心戳肺的事。你要像照顾小孩一样仔细对待，爱护她，呵护她。上篇提到细胞培养的注意事项（点此蓝色字体查看），反响热烈，这次就来讲讲细胞培养常见问题的原因及对策。1 培养液 pH 值变化太快>>>>原因CO2 张力不对培养瓶盖拧得太紧NaHCO3 缓冲系统缓冲力不足培养液中盐浓度不正确细菌、酵母或真菌污染>>>>对策按培养液中 NaHCO3 浓度增加或减少培养箱内 CO2 浓度，2.0 g/L 到 3.7 g/L 浓度 NaHCO3 对应 CO2 浓度为 5％ 到 10％。或者改用不依赖 CO2 培养液松开瓶盖 1/4 圈加 HEPES 缓冲液至 10 到 25 mM 终浓度在 CO2 培养环境中改用基于 Earle’s 盐配制的培养液，在大气培养环境中培养改用 Hank’s 盐配制的培养液丢弃培养物或用抗生素除菌2 培养液出现沉淀，pH 值不变>>>>原因用洗涤剂清洗后残留磷酸盐将培养基成分沉淀下来冰冻保存培养液>>>>对策用去离子水反复冲洗玻璃器皿，然后除菌将培养液加热到 37

CCK 试剂盒，为 MTT 法的替代方法，是一种基于 WST（水溶性四唑盐，化学名：2 -（2 - 甲氧基 - 4 - 硝苯基）- 3 -（4 - 硝苯基）- 5 -（2,4 - 二磺基苯）- 2H - 四唑单钠盐）的广泛应用于细胞增殖和细胞毒性的快速高灵敏度检测试剂盒。CCK 法与其它检测方法之间的比较

6 月 7 日，2018 自然指数年度榜单（Nature Index 2018 Annual Tables）正式发布，中国科学院连续第六年位列该榜单全球十大科研机构首位。2018 年 6 月起，自然指数的期刊数量已由原先的 68 本增至 82 本，新增 18 本期刊，剔除 4 本期刊。自然指数的新版 82 本期刊如下表，其中综合性期刊 5 本，生物学 24 本，医学 11 本，工程技术 7 本，化学 10 本，环境科学 5 本，物理学 10 本，地学和天文学 10 本。我们重点介绍一下生物和医学领域新增的 7 本期刊以及综合性期刊。1、Science Advances，Science 杂志子刊，定位类似 Nature 子刊 Nature Communications，综合性期刊，由于是新期刊，目前尚无影响因子，本月中旬新的影响因子将公布，Science Advances 将会诞生首个影响因子，据预测，首个影响因子将在 10 分左右。2、Science Translational Medicine，Science 杂志子刊，也是 Science 杂志影响因子最高的子刊，也是转化医学领域顶