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常用软件相关知识

丁香园论坛

1767
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=155886&sty=1&tpg=63&age=0
很小的一个软件,也许会有用。可以预测PCR结果,模拟产物电泳效果。

序列同源性的分析:
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=203297&sty=1&tpg=59&age=0
序列分析和多序列比较
BLAST Web site
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
FASTA at EBI
http://www2.ebi.ac.uk/fasta3/
CLUSTALW software
ftp://ftp-igbmc.u-strasbg.fr/pub/ClustalW
HMMER software
http://hmmer.wustl.edu/
SAMprofilesoftware
http://www.cse.ucsc.edu/research/compbio/sam.html
BCM Search Launcher
http://kiwi.imgen.bcm.tmc.edu:8088/searchlauncher/launcher.html

生物学软件使用(不错)
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=293362&sty=1&tpg=31&age=0

画图软件
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=806055&sty=1&tpg=4&age=0

gengbank的使用
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=728654&sty=1&tpg=9&age=0
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=752273&sty=1&tpg=10&age=0

NCBI的BLAST用法;
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=663781&sty=1&tpg=6&age=0
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Education/BLASTinfo/tut1.html
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=497353&sty=1&tpg=25&age=0
生物信息学版版主biozy关于blast也有详细介绍

分子生物学常用软件
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=317578&sty=1&tpg=19&age=0

如何使用LocusLink来找自己的基因序列
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=720311&sty=1&tpg=2&age=0

由于归档库的建立,部分索引的链接发生了变化,但本贴还没有对其进行更新。帖子仍然存在,只是链接变了。解决的办法是用标题搜索本版,即可查到原贴。

【提议】请查到归档链接的战友,跟贴给出新的链接,我们根据您的链接对上述索引进行更新,以方便其他战友的使用。对给出有效链接的战友,我们将加分奖励。

参考格式:
【标题】
【原链接】
【现链接】
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