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TRANSFAC数据库

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TRANSFAC数据库是关于转录因子、它们在基因组上的结合位点和与DNA结合的profiles的数据库。由SITE、GENE、FACTOR、CLASS、MATRIX、CELLS、METHOD和REFERENCE等数据表构成。此外,还有几个与TRANSFAC密切相关的扩展库:PATHODB库收集了可能导致病态的突变的转录因子和结合位点;S/MART DB收集了与染色体结构变化相关的蛋白因子和位点的信息;TRANSPATH库用于描述与转录因子调控相关的信号传递的网络;CYTOMER库表现了人类转录因子在各个器官、细胞类型、生理系统和发育时期的表达状况。TRANSFAC及其相关数据库可以免费下载,也可以通过Web进行检索和查询。

 

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