回文序palindrome

互联网2013-11-14

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在 DNA上碱基顺序形成一种回文结构（无论从左读，还是从右读都是一样的结构），称为回文序。在真核生物染色体 DNA上发现的回文序，一般可用下列结构表示：

5′…… ABC…… t…… C′ B′ A′…… 3′

3′…… A′ B′ C′…… t′…… CBA…… 5′

其长度为几百个至一千个核苷酸，中央的 t， t′部分在几个核苷酸以内。通常是几个连接起来作为一个整体，由几千个核苷酸对形成回文序区域。回文序区域由几万至几十万个核苷酸对相互隔开，分布到整个染色体。若将变性的 DNA复性，仅回文序部分迅速形成发卡结构的双链，所以很易检出。限制酶等可识别的 DNA部分的碱基顺序如：

G A A T T C

C T T A A G

从一条链的左面读与从另一条链的右面读的顺序是相同的（或大致相同），多数情况形成短回文序结构，在 DNA上广泛分布着。目前已发现在原核生物的操纵基因区域等有十几个核苷酸对的回文序，与阻遏蛋白等特异地结合。认为这种短回文序是为了决定 DNA上特定位置的一种结构。