动植物组织mRNA提取实验方法
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一、材料
水稻叶片或小鼠肝组织。
二、设备
研钵,冷冻台式高速离心机,低温冰箱,冷冻真空干燥器,紫外检测仪,电泳仪,电泳槽。
三、试剂
1. 无RNA酶灭菌水:用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃ 2小时)装蒸馏水,然后加入0.01%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。
2. 75%乙醇:用DEPC处理水配制75%乙醇,(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。
3. 1×层析柱加样缓冲液;20 mmol/L Tris-HCl(pH7.6),0.5 mol/L NaCl,1 mmol/L EDTA(pH8.0),0.1% SDS。
4. 洗脱缓冲液:10 mmol/L Tris-HCl(pH7.6),1 mmol/L EDTA(pH8.0),0.05% SDS。
四、操作步骤
(一)动植物总RNA提取-Trizol法
Trizol法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫克至几克。用Trizol法提取的总RNA绝无蛋白和DNA污染。RNA可直接用于Northern斑点分析,斑点杂交, Poly(A)+分离,体外翻译,RNase封阻分析和分子克隆。
1. 将组织在液N中磨成粉末后,再以50-100 mg组织加入1 ml Trizol液研磨,注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%。
2. 研磨液室温放置5分钟,然后以每1 mlTrizol液加入0.2 ml的比例加入氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒。
3. 取上层水相于一新的离心管,按每mlTrizol液加0.5 ml异丙醇的比例加入异丙醇,室温放置10分钟,12000 g离心10分钟。
4. 弃去上清液,按每ml Trizol液加入至少1 ml的比例加入75%乙醇,涡旋混匀,4 ℃下7500 g离心5分钟。
5. 小心弃去上清液,然后室温或真空干燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度。然后将RNA溶于水中,必要时可55 ℃-60 ℃水溶 10分钟。RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70 ℃。
[注意]
1. 整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。
2. 加氯仿前的匀浆液可在-70 ℃保存一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在4 ℃保存一周,-20 ℃保存一年。
(二)mRNA提取
由于mRNA末端含有多poly(A)+,当总RNA流径oligo(dT)纤维素时,在高盐缓冲液作用下,mRNA被特异的吸附在oligo(dT)纤维素柱上,在低盐浓度或蒸馏水中,mRNA可被洗下,经过两次oligo(dT) 纤维素柱,可得到较纯的mRNA。
1. 用0.1 mol/L NaOH悬浮0.5-1.0 g oligo(dT)纤维素。
2. 将悬浮液装入灭菌的一次性层析柱中或装入填有经DEPC处理并经高压灭菌的玻璃棉的巴斯德吸管中,柱床体积为0.5-1.0 ml,用3倍柱床体积的灭菌水冲洗柱床。
3. 用1x柱层析加样缓冲液冲洗柱床,直到流出液的pH值小于8.0。
4. 将(一)中提取的RNA液于65 ℃温育5分钟后迅速冷却至室温,加入等体积2x柱层析缓冲液,上样,立即用灭菌试管收集洗出液,当所有RNA溶液进入柱床后,加入1倍柱床体积的1x层析柱加样溶液。
5. 测定每一管的OD260,当洗出液中OD为0时,加入2-3倍柱床体积的灭菌洗脱缓冲液,以1/3至1/2柱床体积分管收集洗脱液。
6. 测定OD260,合并含有RNA的洗脱组分。
7. 加入1/10体积的3 M NaAc(pH5.2), 2.5倍体积的冰冷乙醇, 混匀, -20 ℃30分钟。
8. 4 ℃下12000 g离心15分钟,小心弃去上清液,用70%乙醇洗 涤沉淀,4 ℃下12000 g离心5分钟。
9. 小心弃去上清液,沉淀空气干燥10分钟,或真空干燥10分钟。
10. 用少量水溶解RNA液,即可用于cDNA合成(或保存在70%乙醇中并贮存于-70 ℃)。
[注意]
1. mRNA在70%乙醇中-70 ℃可保存一年以上。
2. oligo(dT)纤维素柱用后可用0.3 mol/l NaOH洗净,然后用层析柱加样缓冲液平衡,并加入0.02%叠氮钠(NaN3)冰箱保存,重复使用。每次用前需用NaOH水层析柱加样缓冲液依次淋洗柱床。