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核酸抽提心得

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最糟糕的心态 - 实验失败了,抱怨试剂不好。实验人员本来是应该拥有修正主义、机会主义、怀疑论等诸多“不完美的”意识,所以一定要用“完美的”自我批评意识来平衡。我为什么没有一双慧眼选择可靠的供应商?我为什么不做预实验检测所购试剂?

最糟糕的知识 - RNase A 的作用。RNase A 是内切酶,内切酶的作用结果是产生片段,而不是单个核苷酸,所以,RNase A 作用于 RNA 的结果是:大的 RNA 变成小的 RNA。为什么不同批次或者不同公司的 RNase A 消化 RNA 的结果不一样呢?因为 RNase A 的纯度不同:RNase A 纯度越高,则RNA 残留的片段就越大!事实上,RNase 的粗制品去除 RNA 的效果是最彻底的,但现在几乎没有公司销售了,可能的原因,一是生产粗制品成本更高,二是其中的杂质可能对 DNA 的完整性有影响。

最糟糕的试剂 - 水。水是所有实验都必须用到的试剂,但却没有人将她当做试剂。复旦的蒸馏原水肯定可以养鱼,因为一周就会出现蓝藻。涉及到酶反应的水,最好用去离子水。

最糟糕的仪器 - 分光光度仪 (核酸分析仪)。太精密,也太集成,使用者在它们面前非常弱势,又不甘于弱势,于是就坚信该仪器的结果;生产商再推出更简洁的设计,到今天,分光光度仪 (核酸分析仪) 真的成为傻瓜仪了。常识告诉我,越是精密的东西,其对外界干扰的反应越激烈。我也没有搞懂这个东西,只是知道:给它配一个稳压电源;将它的家安在震动最小的地方 - 决不与离心机同台;如果出现了不可解释的结果,宁可相信仪器在发脾气。

最糟糕的操作 - 去除离心管中的溶液。将离心管中的液体倒掉,能倒得多彻底?不同的离心管会有不同,但残留量绝对会出乎想象的。该操作是如此的常见,强烈建议自行实验看一看:在下次做核酸抽提时,75% 乙醇洗涤后离心,倒掉乙醇,再将离心管置于离心机短暂离心,看一看有多少残留液体。不要以为乙醇会挥发就无所谓,盐可不会挥发。常规实验之所以难做到 100% 顺利,其原因就在于没有消除前面的隐患 � 隐患者,偶尔为之是也。

最糟糕的遗忘 - 产品目录。知名公司的产品目录绝对是一个宝库。知名公司产品目录中的知识,其可靠程度远远大于参考书。当“分子克隆”与 Sigma 关于某一问题的解释矛盾时,我选择 Sigma 的解释。知名公司似乎深谙一点:在研究人员眼里,他们的知识错误更易被解释为欺骗,而参考书中的错误,我们是会宽容的;同人相轻,但只是人民内部矛盾,而与公司之间是敌我矛盾。

最糟糕的懒惰 - 苯酚的 pH 值测定。“分子克隆”、Sigma、Invitrogen 都有关于 Tris 饱和苯酚的 pH 值的判断方法: “分子克隆”测酚相,Sigma 测水相,Invitrogen 测稀释的酚相。同一瓶 Tris 饱和苯酚,用这三个方法 (pH 试纸) 测定的结果是什么样的?新版“分子克隆”改掉了上一版关于 RNase A 灭活 DNase 操作的错误,下一版应该会改掉关于测定苯酚 pH 值的错误吧。

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