分子生物学常用溶液配制
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分子生物学常用溶液配制
一、分子生物学常用贮存液的配制
1 . 30% 丙烯酰胺溶液
【配制方法】 将29g丙烯酰胺和1g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。用滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。
【注意】 丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收,其作用具累积性。称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能会含有少量未聚合材料。
一些价格较低的丙烯酰胺和双丙烯酰胺通常含有一些金属离子,在丙烯酰胺贮存液中加入大约0.2体积的单床混合树脂(MB-1Mallinckrodt),搅拌过夜,然后用Whatman 1号滤纸过滤以纯化之。
在贮存期间,丙烯酰胺和双丙烯酰胺会缓慢转化成丙烯酰和双丙烯酸。
2 . 40% 丙烯酰胺
【配制方法】 把380g丙烯酰胺(DNA测序级)和20g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为600ml的蒸馏水中。继续按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法处理,但加热溶解后应以蒸馏水补足至终体积为1L。
【注意】 见上述配制30%丙烯酰胺的说明,40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列测定。
3 .放线菌素 D 溶液
【配制方法】 把20mg放线菌素D溶解于4ml 100%乙醇中,1:10稀释贮存液,用100%乙醇作空白对照读取OD440 值。放线菌素D(分子量为1255)纯品在水溶液中的摩尔消化系数为21,900,故而1mg/ml的放线菌素D溶液在440nm处的吸光值为0.182,放线菌素D的贮存液应放在包有箔片的试管中,保存于-20℃。
【注意】 放线菌素D是致畸剂和致癌剂,配制该溶液时必须戴手套并在通风橱内操作,而不能在开放在实验桌面上进行,谨防吸入药粉或让其接触到眼睛或皮肤。
药厂提供的作治疗用途的放线菌素D制品常含有糖或盐等添加剂。只要通过测量贮存液在440nm波长处的光吸收确定放线菌素D的浓度,这类制品便可用于抑制自身引导作用。
4 . 0.1mol/L 腺苷三磷酸( ATP )溶液
【配制方法】 在0.8ml水中溶解60mg ATP,用0.1mol/L NaOH调至pH值至7.0,用蒸馏水定容1ml,分装成小份保存于-70℃
5 . 10mol/L 乙酸酰溶液
【配制方法】 把770g乙酸酰溶解于800ml水中,加水定容至1L后过滤除菌。
6 . 10% 过硫酸铵溶液
【配制方法】 把1g过硫酸铵溶解于终量为10ml的水溶液中,该溶液可在4℃保存数周。
7 . BCIP 溶液
【配制方法】 把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二钠盐(BCIP)溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃
8 . 2×BES 缓冲盐溶液
【配制方法】 用总体积90ml的蒸馏水溶解1.07g盐溶液BES[N,N-双(2-羟乙基)-2-氨基乙磺酸]、1.6g NaCl和0.027g Na2 HPO4 ,室温下用HCl调节该溶液的pH值至6.96、然后加入蒸馏水定容至100ml,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成小份,保存于-20℃。
9 . 1mol/L CaCl2 溶液
【配制方法】 在200ml蒸馏水中溶解54g CaCl2 ・6H2 O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成10ml小份贮存于-20℃。
【注意】 制备感受态细胞时,取出一小份解冻并用蒸馏水稀释至100ml,用Nalgene滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,然后骤冷至0℃。
10 . 2.5mol/L CaCl2 溶液
【配制方法】 在20ml蒸馏水中溶解13.5g CaCl2 ・6H2 O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。
11 . 1mol/L 二硫苏糖醇( DTT )溶液
【配制方法】 用20ml 0.01mol/L乙酸钠溶液(pH5.2)溶解3.09g DTT,过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。
【注意】 DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。
12 .脱氧核苷三磷酸( dNTP )溶液
【配制方法】 把每一种dNTP溶解于水至浓度各为100mmol/L左右,用微量移液器吸取0.05mol/l Tris碱分别调节每一dNTP溶液的pH值7.0(用pH试纸检测),把中和后的每种dNTP溶液各取一份作适当稀释,在下表中给出的波长下读取光密度计算出每种dNTP的实际浓度,然后用水稀释成终浓度为50mmol/L的dNTP,分装成小份贮存于-70℃。
碱基 |
波长(nm) |
消化系数(ε)[L/(mol・cm)] |
A |
259 |
1.54×104 |
G |
253 |
1.37×104 |
C |
271 |
9.10×103 |
T |
260 |
7.40×103 |
比色杯光径为1cm时,吸光度=εM
13 . 0.5mol/l EDTA(pH8.0) 溶液
【配制方法】 在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na・2H2 O),在磁力搅拌器上剧烈搅拌,用NaOH调节溶液的pH值至8.0(约需20g NaOH颗粒)然后定容至1L,分装后高压灭菌备用。
【注意】 EDTA二钠盐需加入NaOH将溶液的pH值调至接近8.0,才能完全溶解。
14.溴化乙锭( 10mg/ml 溶液)
【配制方法】 在100ml水中加入1g溴化乙锭,磁力搅拌数小时以确保其完全溶解,然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中,保存于室温。
【注意】 小心:溴化乙锭是强诱变剂并有中度毒性,使用含有这种染料的溶液时务必戴上手套,称量染料时要戴面罩。
15 . 2×HEPES 缓冲盐溶液
【配制方法】 用总量为90ml的蒸馏水溶解1.6g NaCl、0.074g KCl、0.027g Na2 PO4 ・2H2 O、0.2g葡聚糖和1gHEPES,用0.5mol/l NaOH调节pH值至7.05,再用蒸馏水定容至100ml。用0.22μm滤器过滤除菌,分装成5ml小份,贮存于-20℃。
16 . IPTG 溶液
【配制方法】 IPTG为异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(分子量为238.3),在8ml蒸馏水中溶解2g IPTG后,用蒸馏水定容至10ml,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。
17 . 1mol/L 乙酸镁溶液
【配制方法】 在800ml水中溶解214.46g四水乙酸镁,用水定容至1L过滤除菌。
18 . 1mol/L MgCl2 溶液
【配制方法】 在800ml水中溶解203.4g MgCl2 ・6H2 O,用水定容至1L,分装成小份并高压灭菌备用。
【注意】 MgCl2 极易潮解,应选购小瓶(如100g)试剂,启用新瓶后勿长期存放。
19 . β- 巯基乙醇( BME )溶液
【配制方法】 一般得到的是14.4mol/L溶液,应装在棕色瓶中保存于4℃。
【注意】 BME或含有BME的溶液不能高压处理。
20 . NBT 溶液
【配制方法】 把0.5g氯化氮蓝四唑溶解于10ml 70%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃。
21 .酚 / 氯仿溶液
【配制方法】 把酚和氯仿等体积混合后用0.1mol/L Tris・HCl(pH7.6)抽提几次以平衡这混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆盖等体积的0.01mol/l Tris・HCl(pH=7.6)液层,保存于4℃。
【注意】 酚腐蚀性很强,并可引起严重灼伤,操作时应戴手套及防护镜,穿防护服。所有操作均应在化学通风橱中进行。与酚接触过的部位皮肤应用大量的水清洗,并用肥皂和水洗涤,忌用乙醇。
22 . 10mmol/L 苯甲基磺酰氟( PMSF )溶液
【配制方法】 用异丙醇溶解PMSF成1.74mg/ml(10mmol/L),分装成小份贮存于-20℃。如有必要可配成浓度高达17.4mg/ml的贮存液(100mmol/L)。
【注意】 PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤,吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。一旦眼睛或皮肤接触了PMSF,应立即用大量水冲洗之。凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。
PMSF在水溶液中不稳定。应在使用前从贮存液中现用现加于裂解缓冲液中。PMSF在水溶液中的活性丧失速率随pH值的升高而加快,且25℃的失活速率高于4℃。pH值为8.0时,20μmmol/l PMSF水溶液的半寿期大约为85min,这表明将PMSF溶液调节为碱性(pH>8.6)并在室温放置数小时后,可安全地予以丢弃。
23 .磷酸盐缓冲溶液( PBS )溶液
【配制方法】 在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2 HPO4 和0.24g KH2 PO4 ,用HCl调节溶液的pH值至7.4加水定容至1L,在15lbf/in2 (1034×105 Pa)高压下蒸气灭菌20min。保存于室温。
24 . 1mol/L 乙酸钾( pH=7.5 )溶液
【配制方法】 将9.82g乙酸钾溶解于90ml纯水中,用2mol/L乙酸调节pH值至7.5后加入纯水定容到1L,保存于-20℃。
25 .乙酸钾溶液(用于碱裂解)
【配制方法】 在60ml 5mol/L乙酸钾溶液中加入11.5ml冰乙酸和28.5ml水,即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度为5mol/L的溶液。
26 . 3mol/L 乙酸钠( pH5.2 和 pH7.0 )溶液
【配制方法】 在80ml水中溶解408.1g三水乙酸钠,用冰乙酸调节pH值至5.2或用稀乙酸调节pH值至7.0,加水定容到1L,分装后高压灭菌。
27 . 5mol/L NaCl 溶液
【配制方法】 在800ml水中溶解292.2g NaCl加水定容至1L,分装后高压灭菌。
28 . 10% 十二烷基硫酸钠( SDS )溶液
【配制方法】 在900ml水中溶解100g电泳级SDS,加热至68℃助溶,加入几滴浓盐酸调节溶液的pH值至7.2,加水定容至1L,分装备用。
【注意】 SDS的微细晶粒易扩散,因此称量时要戴面罩,称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS,10%SDS溶液无须灭菌。
29 . 20×SSC 溶液
【配制方法】 在800ml水中溶解175.3g NaCl和88.2g柠檬酸钠,加入数滴10mol/l NaOH溶液调节pH值至7.0,加水定容至1L,分装后高压灭菌。
30 . 20×SSPE 溶液
【配制方法】 在800ml水中溶解17.5g NaCl、27.6g NaH2 PO4 ・H2 O和7.4g EDTA,用NaOH溶液调节pH值至7.4(约需6.5ml 10ml/L NaOH),加水定容至1L,分装后高压灭菌。
31 . 100% 三氯乙酸溶液
【配制方法】 在装有500g TCA的瓶中加入227ml水,形成的溶液含有100%(M/V)TCA。
32 . 1mol/L Tris 溶液
【配制方法】 在800ml水中溶解121.91g Tris碱,加入浓HCl调节pH值至所需值。
pHHCl 7.4 70ml 7.6 60ml 8.0 42ml
应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值,加水定容至1L,分装后高压灭菌。
【注意】 如1mol/L溶液呈现黄色,应予丢弃并置备质量更好的Tris。
尽管多种类型的电极均不能准确测量Tris溶液的pH值,但仍可向大多数厂商购得合适的电极。
Tris溶液的pH值因温度而异,温度每升高1℃,pH值大约降低0.03个单位。例如:0.05mol/L的溶液在5℃、25℃、和37℃时的pH值分别为9.5、8.9和8.6。
33 . Tris 缓冲盐溶液( TBS )( 25mmol/l Tris )
【配制方法】 在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl和3g Tris碱,加入0.015g酚并用HCl调至pH值至7.4,用蒸馏水定容至1L,分装后在151bf/in2(1.034×105 Pa)高压下蒸汽灭菌20min,于室温保存。
34 . X-gal 溶液
【配制方法】 X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。用二甲基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的贮存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中,装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏,并应贮存于-20℃。X-gal溶液无须过滤除菌。
二、常用抗生素溶液
|
贮存液a |
工作浓度 |
||
浓度 |
保存条件 |
严紧型质粒 |
松弛型质粒 |
|
氨苄青霉素 |
50mg/ml(溶于水) |
-20℃ |
20μg/ml |
60μg/ml |
羧苄青霉素 |
50mg/ml(溶于水) |
-20℃ |
20μg/ml |
60μg/ml |
氯霉素 |
34mg/ml(溶于乙醇) |
-20℃ |
25μg/ml |
170μg/ml |
卡那霉素 |
10mg/ml(溶于水) |
-20℃ |
10μg/ml |
50μg/ml |
链霉素 |
10mg/ml(溶于水) |
-20℃ |
10μg/ml |
50μg/ml |
四环素b |
5mg/ml(溶于乙醇) |
-20℃ |
10μg/ml |
50μg/ml |
a:以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。
b:镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。
三、常用的电泳缓冲液
缓冲液 |
使用液 |
浓贮存液(每升) |
Tris-乙酸(TAE) |
1×:0.04mol/L Tris-乙酸 |
50×:242g Tris碱 |
|
0.001mol/L EDTA |
57.1ml冰乙酸 |
|
|
100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) |
Tris-磷酸(TPE) |
1×:0.09mol/L Tris-磷酸 |
10×:10g Tris碱 |
|
0.002mol/L EDTA |
15.5ml85%磷酸(1.679g/ml) |
|
|
40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) |
Tris-硼酸(TBE)a |
0.5×0.045mol/L Tris-硼酸 |
5×:54g Tris碱 |
|
0.001mol/L EDTA |
27.5硼酸 |
|
|
20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) |
碱性缓冲液b |
1×:50mmol/L NaOH |
1×:5ml 10mol/L NaOH |
|
1mmol/L EDTA |
2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0) |
Tris-甘氨酸c |
1×:25mmol/L Tris |
5×:15.1g Tris |
|
250mmol/L 甘氨酸 |
94g 苷氨酸(电泳级)(pH8.3) |
|
0.1% SDS |
50ml 10% SDS(电泳级) |