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重组载体的构建及鉴定

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重组载体的构建及鉴定


引言:根据实验目的,设计需要重组目的基因或RNAi片段,通过生物合成公司合成,需要说明的是设计的每条单链DNA其两端都应有没切位点,以便于重组。

1. 合成 的 ssDNA ,分别命名:编码链为 Forward ssDNA , 模板链为 Reverse ssDNA , 每1 OD ssDNA 各加33 μl 无菌去离子水溶解,分别取18 μl 进行退火。

在1.5ml Eppendorf管中依次加入以下试剂

10× PCR buffer 4μl

Forward ssDNA 18μl

Reverse ssDNA 18μl

总体积 40μl

混匀,离心集中样品。 90 ℃ 5min ,缓慢冷却至室温。

2. dsDNA 的双酶切

dsDNA 的 Hind Ⅲ 和 BamH Ⅰ双酶切

1.5ml Eppendorf 管中依次加入以下试剂

10×Tango buffe r 10μl

酶1 1 μl

酶2 1 μl

dsDNA 20μl

无菌去离子水 17μl

总体积 50μl

(注意: buffe r 的选择要根据你所用的酶1,2来确定,如下表:


B+(BLUE)

G+(GREEN)

O+(ORANGE )

R+(RDE)

BUFFER Y+ 1X

TANGO

2X
 

BamH1

20-5undefined

100

20-50

50-10undefined

10undefined
50-100
 

Hind Ⅲ

0-20

20-50

0-20

0-20

50-100

50-100
 


BamH1,Hind Ⅲ 在 2XTANGO中活性比其他几种BUFFER中要高,因此我们如果要用BamH1,Hind Ⅲ 做双酶切的话,首选的BUFFER是 TANGO,下面的双酶切中BUFFER 选择也是一样的 )。

混匀,离心集中样品。 37 ℃ 温育过夜,次日,酚氯仿抽提一次, -20 ℃ 无水乙醇沉淀过夜。再次日, 4 ℃ 10000rp m 离心 10min 。 沉淀用 70 ﹪的酒精洗涤一次, 37 ℃ 烘干,加 200μl 无菌去离子水溶解。

3 质粒载体 的双酶切。

 

1.5ml Eppendorf 管中依次加入以下试剂

R buffer 5μl

酶1 1 μl

酶 Ⅱ 1μl

空质粒 5μl

无菌去离子水 38. 5 μl

总体积 50μl

混匀,离心集中样品。37 ℃ 温育4h,取10 μl 进行1.0 ﹪ 的琼脂糖凝胶电泳。

4 pSUPER.basic 双酶切后大片段凝胶回收

使用BioDev北京博大泰克得 B 型小量 DNA 片段快速胶回收试剂盒,按说明书的步骤回收大片段。

5 双酶切后的 空载体 与 dsDNA 连接。

连接体系如下:

1.5ml Eppendorf 管中依次加入以下试剂

 

T4 Ligase buffer 1 μl

T4 ligase 1 μl

dsDNA 1 μl

空质粒 4 μl

无菌去离子水 3 μl

总体积 10 μl

混匀,离心集中样品,16 ℃ 连接过夜。

6 连接产物的转化

5lu双酶切dsDNA加入到100ul 感受态细胞(JM109),冰浴30min,42 0 热休克90s,加入400ul无抗的LB ,37 0 ,150rpm,1h,涂平板。37 0

过夜。

7 质粒提取。

8 PCR鉴定。

注:这些都是我们的工作经验总结,多少次失败后的成功经验,也有好多PCR,双酶切的图片,可惜没有办法上传,如果有什么问题,我们可以交流,QQ27793402,邮箱:yangyang_won@163.com
 

(责任编辑:大汉昆仑王)
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