RNA的制备
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来源于任何细胞的RNA都可以通过反转录酶的作用拷贝成双链DNA并克隆化,获得相应的于特定细胞来源的cDNA文库。因此,RNA制备的意义有两个方面
~undefined 获得特定细胞来源的cDNA文库,克隆目的基因
~undefined 分析基因的表达,阐明基因调控的特性,了解从基因转录产生RNA的结构,数量,水平及合成的速率
抑制RNA酶活性的方法
1. 灭菌法:将RNA提取过程中的使用的器具进行高温灭菌处理(180 ºC,8h),溶液等在高压下蒸汽灭菌15min(1.034 X 105 Pa)
2. 焦碳酸二乙酯(DEPC)抑制法:DEPC是RNA酶的强烈抑制剂,塑料或玻璃器皿在含0.1%的DEPC溶液中浸泡2h,然后以灭菌水淋洗数次,在100 ºC下干烤15min。
3. RNA酶抑制剂法:利用RNA酶蛋白质抑制剂与RNA酶紧密结合防止其发挥酶活作用;利用氧钒核糖核苷复合物与RNA酶结合;利用硅藻土吸附RNA酶。
一、细菌RNA的制备
1.菌体培养 同上
2. 离心收集菌体菌体
经离心(5000g,5min)后,悬浮于终止缓冲液中(200mM Tris-HCl,pH8.0; 20 mM EDTA; 20 mM Na2N3; 20 mM 金精三羧酸(ATA))
3. 菌体裂解
加入STET缓冲液(8% 蔗糖; 5% Triton X-100; 50mM EDTA; 50mM Tris-HCl pH 7.0)悬浮加入0.2 M 的VRC (0.2M和10 mM的氧钒核苷复合物)
4. RNA提取
加入0.5 V的苯酚振荡1 min,0.5 V氯仿振荡1 min,10 000 g, 10 min,水相加入1/10 V的NaAc, 2 V的无水乙醇10000 g, 10 min沉淀溶于0,2 M 的VRC,以酚-氯仿抽提两次
5. RNA纯化
重溶沉淀于DEPC(焦碳酸二乙酯)处理的水中,加入CsCl溶液,于室温离心(200000 g,1 h)回收RNA沉淀,溶于DEPC处理的水中,加入1/10 V的3 M的NaAc, 2 V的乙醇,离心后
6.RNA的溶解
将RNA沉淀溶于水中
二、植物组织细胞RNA的制备
1.细胞处理: 将植物组织置于液氮中冻结,研成粉末,加入匀浆缓冲液,高速匀浆,后高速离心(20000g,10 min)
2.RNA提取:上清液中加入皂土(4%),等体积的酚,低温振荡5min,200000 g, 10 min
3.重复该步骤一次
4.RNA沉淀: 于上清液中加入KAc至终浓度为0.2 M,加两倍体积 的无水乙醇,于0oC 30 min,30000g,20 min
5.RNA的溶解:沉淀溶于水中或TE缓冲液
三、哺乳动物细胞质RNA的制备
1. 细胞培养 : 人工组织培养
2.细胞裂解:以含磷酸缓冲液(PBS)的生理盐水洗细胞悬浮于预冷的溶胞缓冲液中,加入24%的蔗糖,1%的NP-40溶胞缓冲液
3.去蛋白: 加入Protease K,于37 ºC温育30 min,酚抽提
4.去DNA:乙醇沉淀,悬浮于DNA消化液(DNase I, 0.2% SDS)
5. 沉淀RNA: 加入终浓度为0.3 M的NaAc, 2V 无水乙醇于-20 ºC 2 h, 离心收集RNA.
四、mRNA的分离提纯—寡聚(dT)-纤维素柱法
上柱缓冲液:
20 mmol/L Tris-HCl (pH7.6)
0.5 mol/L NaCl
1 mmol/L EDTA (pH8.0)
0.1% 十二烷基肌氨酸钠
洗脱缓冲液:
10 mmol/L Tris-HCl (pH 7.6)
1 mmol/L EDTA (pH8.0)
0.05% SDS
寡聚(dT)-纤维素柱法提纯mRNA的过程
~undefined 获得特定细胞来源的cDNA文库,克隆目的基因
~undefined 分析基因的表达,阐明基因调控的特性,了解从基因转录产生RNA的结构,数量,水平及合成的速率
抑制RNA酶活性的方法
1. 灭菌法:将RNA提取过程中的使用的器具进行高温灭菌处理(180 ºC,8h),溶液等在高压下蒸汽灭菌15min(1.034 X 105 Pa)
2. 焦碳酸二乙酯(DEPC)抑制法:DEPC是RNA酶的强烈抑制剂,塑料或玻璃器皿在含0.1%的DEPC溶液中浸泡2h,然后以灭菌水淋洗数次,在100 ºC下干烤15min。
3. RNA酶抑制剂法:利用RNA酶蛋白质抑制剂与RNA酶紧密结合防止其发挥酶活作用;利用氧钒核糖核苷复合物与RNA酶结合;利用硅藻土吸附RNA酶。
一、细菌RNA的制备
1.菌体培养 同上
2. 离心收集菌体菌体
经离心(5000g,5min)后,悬浮于终止缓冲液中(200mM Tris-HCl,pH8.0; 20 mM EDTA; 20 mM Na2N3; 20 mM 金精三羧酸(ATA))
3. 菌体裂解
加入STET缓冲液(8% 蔗糖; 5% Triton X-100; 50mM EDTA; 50mM Tris-HCl pH 7.0)悬浮加入0.2 M 的VRC (0.2M和10 mM的氧钒核苷复合物)
4. RNA提取
加入0.5 V的苯酚振荡1 min,0.5 V氯仿振荡1 min,10 000 g, 10 min,水相加入1/10 V的NaAc, 2 V的无水乙醇10000 g, 10 min沉淀溶于0,2 M 的VRC,以酚-氯仿抽提两次
5. RNA纯化
重溶沉淀于DEPC(焦碳酸二乙酯)处理的水中,加入CsCl溶液,于室温离心(200000 g,1 h)回收RNA沉淀,溶于DEPC处理的水中,加入1/10 V的3 M的NaAc, 2 V的乙醇,离心后
6.RNA的溶解
将RNA沉淀溶于水中
二、植物组织细胞RNA的制备
1.细胞处理: 将植物组织置于液氮中冻结,研成粉末,加入匀浆缓冲液,高速匀浆,后高速离心(20000g,10 min)
2.RNA提取:上清液中加入皂土(4%),等体积的酚,低温振荡5min,200000 g, 10 min
3.重复该步骤一次
4.RNA沉淀: 于上清液中加入KAc至终浓度为0.2 M,加两倍体积 的无水乙醇,于0oC 30 min,30000g,20 min
5.RNA的溶解:沉淀溶于水中或TE缓冲液
三、哺乳动物细胞质RNA的制备
1. 细胞培养 : 人工组织培养
2.细胞裂解:以含磷酸缓冲液(PBS)的生理盐水洗细胞悬浮于预冷的溶胞缓冲液中,加入24%的蔗糖,1%的NP-40溶胞缓冲液
3.去蛋白: 加入Protease K,于37 ºC温育30 min,酚抽提
4.去DNA:乙醇沉淀,悬浮于DNA消化液(DNase I, 0.2% SDS)
5. 沉淀RNA: 加入终浓度为0.3 M的NaAc, 2V 无水乙醇于-20 ºC 2 h, 离心收集RNA.
四、mRNA的分离提纯—寡聚(dT)-纤维素柱法
上柱缓冲液:
20 mmol/L Tris-HCl (pH7.6)
0.5 mol/L NaCl
1 mmol/L EDTA (pH8.0)
0.1% 十二烷基肌氨酸钠
洗脱缓冲液:
10 mmol/L Tris-HCl (pH 7.6)
1 mmol/L EDTA (pH8.0)
0.05% SDS
寡聚(dT)-纤维素柱法提纯mRNA的过程