原理
大多数的信使RNA(mRNA)都带有poly(A)尾,而结构RNA没有。使用本工作方案,可以将带poly(A)的RNA从rRNA和tRNA中分离出来。
材料与仪器
RNA
NaOH 寡聚脱氧胸苷纤维素 poly(A)样品缓冲液 LiCl EDTA TE 乙酸钠
离心机 分光光度计 摇床
NaOH 寡聚脱氧胸苷纤维素 poly(A)样品缓冲液 LiCl EDTA TE 乙酸钠
离心机 分光光度计 摇床
步骤
1. 先用10 ml 5 mol/l NaOH清洗硅化的层析柱,然后用水冲洗。
2. 取0.5 g oligo(dT)纤维素干粉加1 ml 0.1 mol/l NaOH中,倒入柱内,以约10 ml 水冲洗。
2. 取0.5 g oligo(dT)纤维素干粉加1 ml 0.1 mol/l NaOH中,倒入柱内,以约10 ml 水冲洗。
3. 用10~20 ml 加样缓冲液平衡柱子,至流出液pH约7.5。
4 于70℃加热含2 mg 总RNA的水溶液10 min,再用10 mol/l LiCl调节溶液中LiCl至终浓度0.5 mol/l。
5. 加RNA溶液至oligo(dT)柱,并以1 ml poly(A)加样缓冲液洗涤,将流出液重新上柱2次以上。
6. 用2 ml 中度洗脱缓冲液洗柱子,用盛有2 ml 2 mmol/l DETA/0.1%SDS的试管收集洗脱的RNA溶液。
7. 按步骤2重新平衡柱子,重复步骤2~4的poly(A)选择吸附和冼脱过程。
8. 调整收集的RNA溶液的乙酸钠浓度至0.3 mol/l,加2.5倍体积乙醇,移至2个硅化的离心管中,-20℃放置过夜或干冰/乙醇中30 min。
9. 于4℃ 304 000 g 离心如沉淀RNA。弃去乙醇,晾干沉淀,重溶于150 ul 无RNA酶的TE缓冲液,合并样品。
10. 取5 ul 在70℃加热5 min 后,在1%琼脂糖凝胶电泳中检查RNA的质量。
7. 按步骤2重新平衡柱子,重复步骤2~4的poly(A)选择吸附和冼脱过程。
8. 调整收集的RNA溶液的乙酸钠浓度至0.3 mol/l,加2.5倍体积乙醇,移至2个硅化的离心管中,-20℃放置过夜或干冰/乙醇中30 min。
9. 于4℃ 304 000 g 离心如沉淀RNA。弃去乙醇,晾干沉淀,重溶于150 ul 无RNA酶的TE缓冲液,合并样品。
10. 取5 ul 在70℃加热5 min 后,在1%琼脂糖凝胶电泳中检查RNA的质量。
常见问题
来源于《cDNA微阵列技术中内标 Poly (A )+ RNA 的制备》
来源:丁香实验