DNA甲基化在肿瘤诊断中应用
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DNA 甲基化在肿瘤诊断中应用
表观遗传 学吸引入的地方就是在肿瘤的早期检测中的应用，因为研究表明表观遗传的变化伴随肿瘤的发生与发展，使用表观遗传学方法可以有助于肿瘤的早期发现。现在肿瘤表观遗传治疗的主要研究方向包括DNA甲基转移酶和组蛋白去乙酰化酶抑制剂的研制及靶向诱导DNA甲基化等。
癌症的早期发现对癌症患者的有效治疗是非常重要的。目前对癌症的诊断主要依据临床症状、图像信号检测和组织病理学检查等，但有许多癌症临床症状出现较晚，并且活体取样检测也困难，严重影响了癌症的早期诊断和病人的预后。研究发现甲基化是肿瘤发生的一个早期事件，且此现象在确诊前就能被检测出来，提示某些基因的DNA甲基化水平有望成为肿瘤早期诊断的潜在指标，甚至可以作为患病风险预测、临床病程监控和疗效评估的指标。
如前所述，监测DNA甲基化有多种方法，但由于MSP操作简单、灵敏、特异，而被认为在人类肿瘤甲基化分析中是一种快速、高效临床研究手段。通过检测血浆、血清、尿液和唾液等体液中肿瘤分子标记物的甲基化水平，解决了获取肿瘤组织困难所引起的问题，有利于肿瘤的早期诊断、预后监测及跟踪随访，然而将其大规模应用于临床还有待于认真评估这些样本中DNA标记物的检测结果与大宗的随机的前瞻性的临床资料间的吻合程度。
常用的肿瘤甲基化标志
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肿瘤类型
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标 志
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DNA来源
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膀胱癌
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CDKN2A
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血浆，血清，尿液
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乳腺癌
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CDKN2A
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血浆
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结肠癌
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MLHl
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血浆
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CDKN2A
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血浆，血清
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食管癌
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APC
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血浆
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CDKN2A
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血清
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胃癌
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CDHl
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血清
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CDKN2A
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血清
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CDKN2B
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血清
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DAPKl
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血清
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GSTP1
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血清
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头颈癌
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CDKN2A
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血清
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DAPKl
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血清，血浆
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MGMT
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血清
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肝癌
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CDKN2A
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血清
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CDKN2B
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血清
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肺癌
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CDKN2A
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血清，血浆
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DAPKl
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血清
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MGMT
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血清
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GSTP1
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血清
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APC
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血清，血浆
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前列腺癌
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GSTPl
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血清，血浆
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目前肿瘤甲基化的研究主要集中在抑癌基因。这是因为人们发现肿瘤的发生可能与抑癌基因启动子区的CpG岛甲基化造成抑癌基因关闭有关。由于CpG岛的局部高度甲基化早于细胞的恶性增生，因此这些基因甲基化的诊断可以用于肿瘤发生的早期预测。另外，全基因组的低甲基化也随着肿瘤的发生而出现，并且其随着肿瘤恶性度的增加而显著下降，因此整体甲基化的检测也可以可用于肿瘤的分级。Shinichi toyooka描述了肿瘤发生与异常甲基化的关系，他发现被SV40感染的人间皮细胞，其端粒酶活性上调，Notch―1基因表达增加，肿瘤相关基因(包括抑癌基因RASSFlA)的启动子区发生异常甲基化。C止等发现部分结肠癌患者的正常肠黏液腺细胞的IGF―2基因印记丢失。Uhlmann等发现不同病理类型及不同恶性程度的神经胶质瘤细胞的7种肿瘤标志基因存在着不同程度的甲基化。因此，甲基化的研究，为肿瘤的早期预测、分类、分级及预后评估提供了新的依据。
