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【交流】不同个体RNA混合后浓度为什么会变高?关于荧光定量中biological replicate和technical replicate

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小弟最近在做荧光定量。

由于荧光定量的灵敏性,一个处理组如果只做3个生物学重复(即每个处理组取3尾实验动物,分别提RNA,分别反转录,做定量),那个体之间的差异,势必会使实验结果难以分析。
【以上内容可参考: http://www.dxy.cn/bbs/topic/16659187 下文中,第1种思路类似该帖中第1种情况。】

为了增大样本量,以更好地估计总体,同时为了减小个体间的差异对实验的影响,且为不使试验成本过高,我身边的人有以下3种思路:

1.每个处理组取9尾实验动物的组织(如,肝脏),然后每3尾实验动物的肝脏混合匀浆,得到3份混合样品,提RNA,反转录得3份cDNA,再做荧光定量;

2. 每个处理组取9尾实验动物的组织(如,肝脏),9尾实验动物单独加Trizol匀浆、加氯仿,在加氯仿之后吸上清时,每3份吸等量上清混合,进行后续步骤,得到3份RNA样品,后续步骤同上;

3.每个处理组取9尾实验动物的组织(如,肝脏),9尾实验动物单独提取RNA,将提得的RNA,每3份混合,得3份RNA混合样,反转录得3份cDNA,荧光定量;(RNA混合原则:RNA混合前测浓度,每份RNA取1μg,组成混合RNA,即每份混合样中含3μg RNA;测RNA混合样的浓度,从每份RNA混合样中取1μg RNA进行反转录)。

小弟认为,以上3种思路中,1和2实际为同一种方法,但其有缺点,如果第一步加的组织重量不同,那么将他们混合,就属于一种不平衡混合;至于3,从每个样品的RNA中中取1μg RNA组成混合样品,所以不存在不均衡混合的问题。

所以小弟今天就尝试第3种方法,可是问题来了
就是混合之后的RNA浓度高于各单个样品的RNA浓度。
举个例子,我吸取1μl的1000ng/μl的RNA(第1个个体)、0.8μl的1250ng/μl的RNA(第2个个体)、0.5μl的2000ng/μl的RNA(第3个个体),组成混合RNA样品,结果得到的RNA浓度却为4000+ng/μl,比这3个RNA浓度都高!!!怀疑是RNA未充分溶解,故将RNA涡旋、离心,4℃静置数小时,仍得同样的结果;混合前后RNA质量均没问题,260/280在1.95左右。

【据此,我提出以下3个问题】:
1. 大家平时在做荧光定量时,通常做几个生物学重复?当生物学重复>5时,是否还做技术重复(复孔)?
2. 对于我提到的3种方法,大家更倾向于哪一种?
3. 哪位高人指点一下,为什么将RNA混合后,浓度会变大?难道不同样品RNA之间存在某种作用?
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