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目录

在苹果机(Macintosh)上的安装与升级 05

通过因特网升级 06
软件安装 07
网络安装 08
疑难解答 12

在PC机(Windows)上安装与升级 17

通过因特网升级 18
软件安装 19

从 EditSeq 开始 21
从 GeneQuest 开始 31
从 MapDraw 开始 44
从 MegAlign 开始 54
从 PrimerSelect开始 65
从 Protean 开始 78
从 SeqMan II 开始 89


L A S E R G E N E

f o r

Wi n d o w s & M a c i n t o s h

DNASTA R I n c . ( 6 0 8 ) 2 5 8 - 7 4 2 0 f a x : ( 6 0 8 ) 2 5 8 - 7 4 3 9
e m a i l : s u p p o r t @ d n a s t a r. c o m

在苹果机(Macintosh)上的安装与升级

通过因特网升级
必备条件 6
下载升级程序 6

软件安装
必备条件 7
从CD安装Lasergene 7

网络安装
必备条件 8
定义 8
Dongle安装 10
服务器安装 10
终端机安装 11

疑难解答
系统配置冲突及网络问题 12
解决网络问题的其他工具 13
授权错误报告 14
程序使用及更多的授权信息 15

通过英特网升级

如果您以前已经安装了Lasergene 而且目前有升级和服务联系,您就可以通过英特网来升级您现有的版本,各种模块(module)都是以自解压形式存储的,你可以选择性的下载安装。

必备条件
您的用户名和会员号是必需的,可以在安装盘上找到。

程序升级
备份您已有的Lasergene,找到您要升级的程序,并把它转移到备份的文件夹中。连接到DNAstar网站的主页(http://www.dnastar.com),从菜单中的Customers中点击Lasergene Updates点,安提示输入密码和用户名(与会员名相同),这样就会打开下载页面,找到Macintosh软件(Macintosh Software),就可以下载您想要的模块了。
模块下载完毕以后,双击文件将其解压缩到已经安装的DNAstar文件夹中替换旧的模块文件。
用Macintosh Finder打开Lasergene浏览器,找到DNAstar文件夹,从FILE MENU选择Update Applications,然后插入安装盘,等待升级完毕。

软件安装

本节介绍若何从CD在苹果机(Macintosh)上安装Lasergene。注意安装是尽量关闭所有其它程序以保证安装顺利进行。

必备条件
一张个人的Lasergene安装盘;
一张Lasergene软件光碟;
足够的硬盘空间和内存:至少30Mb的硬盘,32Mb的RAM。

从光盘安装Lasergene
插入安装盘和安装光盘,双击图标,则出现下面的窗口,点击继续则出现安装窗口。
窗口中有两种安装选择:简易安装和一般安装。
简易安装可以运行于68K-family and Power Macintoshes。
而一般安装可以安装工作站文件、执行文件和样品资料,我们推荐使用简易安装,如果使用一般安装可以节省5Mb的空间。
注意安装完毕后,要重新启动计算机。

网络安装

Lasergene网络系统是可以运行于局域网计算机上的软件。他有两部分组成:一是资料服务器,服务器要有较大的硬盘和较高的运行速度;二是与服务器相连的终端机。后者通过一个称为dongle的Lasergene硬盘设备相连进行管理。

必备条件
安装磁盘(服务器版)
客户端磁盘,包括安装盘(终端版)和Disk 1(终端版)。
Lasergene软件光盘
DNAstar网络用dongle
盘足够的硬盘空间和内存:服务器至少30Mb的硬盘,8Mb的RAM。终端机至少1Mb的硬盘,32Mb的RAM。

定义
在安装Lasergene网络系统之前要熟悉以下术语:
  应用程序:指EditSeq, GeneMan, GeneQuest, MapDraw, MegAlign, PrimerSelect, Protean, and SeqMan II。
  应用程序服务器:是指存储应用程序的电脑,通常与dongle服务器是同一个服务器,但也可以不同,当在局部硬盘上安装网络程序时,也可以在同一个网络系统中同时存在多个不同的应用程序服务器,而且应用程序服务器不一定是苹果机,储存应用程序的机器也不一定必须能够运行该程序,仅仅是储存而已。
  终端机安装(又称工作站安装),安装网络版本Lasergene运行的最小软件部分,它包括以下在内:LicenseKeeper,Navigator,和系统资源。
  终端机:这可以是任何不作为Dongle Server的网络上的机器。终端机是任何最少穿过终端机安装的机器,这样是使得Lasergene应用程序运行需要的最少、最低限度的软件。
  Dongle:Dongle是网络版Lasergene需要的硬件装置。每个网络系统都需要单独的Dongle。dongle是末端上带1个短的电缆的小的矩形的装置。有2不同的种类的dongles:一种是在计算机背后可与调制解调器端口连起来,有9个pin插头;另一种有4个别针阳插头,连接鼠标和键盘。
  Dongle服务器:这是装有Dongle的机器,它肯定是最少穿过终端机安装的苹果计算机,这机器应该始终保持运行。
  Navigator:是为了更简单的进行Lasergene应用设计的工具。在必要的情况下,Navigator将自动安装网络组件,而且为网络安装诊断工具。
  LicenseKeeper:和Dongle交流的持有人的系统扩展部分。它告诉dongle哪个应用被开始,这样,dongle才允许末个机器程序运行。
  服务器安装: 指Lasergene软件的完整安装,包括应用程序、LicenseKeeper、Navigator和系统资源。

Dongle安装
使Lasergene网络版能够运行的第一个操作就是安装dongle。在你安装之前,请检查你的dongle是否有9-别针连接器(connector)或4-别针连接器(connector)。
  关闭你打算装dongle服务器那台苹果计算机的电源。
  如果你的dongle有9-别针连接器(connector),把它连接到你的计算机调制解调器的端口上。调制解调器端口是一个有9个外置接口的设备,位于你的苹果计算机的后面的展示板上,电话听筒图标的附近。
  如果你的dongle有4-别针连接器,从键盘断开鼠标,把dongle接在键盘上,接着,把你的鼠标接在dongle上。
  重新启动苹果计算机。
  如果你的dongle被接在苹果计算机上,你必须按照dongle服务器那样进行软件安装。如果你打算将这机器作为文件服务器,请安服务器安装的方法安装。如果你不打算将这机器作为文件服务器,请安终端机安装的方法安装。在对dongle服务器施行成功的软件安装之后,在启动时应该出现右面的服务器图标。

服务器安装(Server Installation)
  这个安装和在第5页上所描述的软件安装过程基本相同的。由于大部分的网络包括机器很多的不同的种类的(68 K,和Power Macintosh机器),所以我们推荐您选择简易安装。
  在完成软件安装之后,如右图操作共享Lasergene应用程序文件夹,这样,其他的网络用户才可以使用。如果你不能确定怎样操作,请和你的网络管理员联络。

终端机安装(Client Installation)
  终端机安装必须在全部需要对Lasergene服务器操作的机器,但不是文件服务器的机器。
  插入安装磁盘终端机版本,然后按照在第5页上软件安装的方法安装。
  随后通过苹果机菜单的选择命令将文件服务器和终端机相连。一些网络可以使用其他的方法进行相连。如果这步你有问题,请和你的网络管理员联络。
  从终端机上的DNASTAR文件夹中运行浏览器。
  从文件菜单,选择寻找应用程序,你应该收到如下信息:全部应程序用都被浏览器找到了。
现在就可以从文件服务器运行Lasergene应用程序了。

疑难解答

系统配置冲突
一些系统配置可能会在安装过程冲突,如果你不能从Lasergene光盘成功地安装,可以关上不必要的配置:
  用计算机控制板上的配置管理器关闭任何不必要的扩展程序。
  或重新启动你的机器,继续安装。
网络疑难
找不到dongle服务器是网络问题中最常见的问题。当你开始运行DNASTAR应用程序时,你会遇到这问题,提示信息显示:DNASTAR许可服务器没有应答,请再试一次。可能有以下几个原因:
  是否装有dongle的计算机被关闭,如果是重启dongle机器即可。
  是否dongle没有接在苹果计算机上,或者不在调制解调器端口或鼠标接口,按照第8页Dongle Installation命令在苹果计算机上重新安装dongle。记住在除掉或者插入dongle之前先关闭计算机。
  如果你的dongle被接在IIfx,Quadra 900或Quadra 950等机子上,你不仅需要重新安装,还要进行如下操作:
从菜单中选择Control Panels中的Serial Switch双击,就会出现右面的窗口。
将Faster 换成Compatible。然后重启计算机。

如果dongle已适当地被接在调制解调器端口上,但是计算机不识别,那可能是你的计算机在 booting 期间里不是别调制解调器端口的记号。用LicenseKeeper按下面的方法寻找调制解调器端口:
启动Navigator。
按Option——NETWORK MENU——Set LicenseKeeper的顺序打开右边的LicenseKeeper对话框。
把Dongle Delay参数放到3秒上。
单击LicenseKeeper,接着Done。
重启苹果计算机。
如果问题还没解决,和DNASTAR联络。

其他解决网络问题方法
要了解您的计算机和全部可通过网络运行DNASTAR的 dongle服务器,选择NETWORK MENU中的Diagnose LicenseKeeper。计算机将告诉您是否dongle被安装到你的计算机上,是否存在LicenseKeeper系统配置。同时显示LicenseKeeper站点识别和版本编号。无论你的计算机的授权状态如何,Navigator都会报告所有已连接的dongle服务器的状态。许可服务器报告在网络地带附近形成,可显示全部对你的网络应答的dongle服务器的用户名,站点识别和版本编号。通常,你的LAN包括单一的dongle服务器,但是,大的网络上可以有几个。如果你的计算机被接在大的LAN上,打开这个报告可能会慢一些。确定全部LicenseKeeper服务器的地点要求network request被送到在LAN上每个区。至少需要1秒钟才能确定是否有回应。

LicenseKeeper错误报告
如果授权系统没有安装,或者和dongle服务器连接困难,Navigator将会发现问题,报告错误信息。下面斜体为错误类型,其后是各自的原因。
LicenseKeeper系统扩展没在系统文件夹或扩展文件夹中。重新安装Lasergene客户端软件。Navigator不能和系统扩展连接,也没在系统文件夹中发现。对于System 7或较晚的Macintoshes,如果你重启计算机时按下Shift键,则可能发生这问题。
当计算机起动的时候,按下了鼠标按钮或Shift键。重启你的机器。因为系统扩展在启动时被失活了,所以Navigator不能和系统扩展交流。
你的机器上安装了较老版本的Mac机网络协议。安装53或更新版本的Mac机网络协议。安装的Mac机网络协议不支持系统扩展。在小的网络或closely-knit的安装上,这将不是问题,因为dongle服务器与其他的客户机在同一个区。如果必要,DNASTAR能为较新版本的Mac机网络协议(AppleTalk)提供驱动和installation script。
不能在网上注册LicenseKeeper。和DNASTAR联络。由于你的计算机上有太多的其他的网络处理,系统扩展不能进行网络操作。这种情况很少见,但如果您的计算机是网络中介的话,有时也会发生。
LicenseKeeper系统扩展所需的内存不够。关闭不必要的系统扩展。如果你的操作系统在你的计算机上使用了全部的内存,这也会发生。。
系统文件夹被保护。去除系统文件夹保护,重启计算机。系统文件夹里的文件和已经使用的文件不能够保存。磁盘压缩和口令保护的扩展时会发生这些问题。
重新安装Lasergene工作站软件。系统扩展使用的系统文件夹里的文件不存在了。

应用程序的使用
为了了解已连接的用户的数目,用户使用了什末程序,程序使用的时间,可以从NETWORK MENU打开Application Usage。窗口中还会显示有关诸如客户/服务器状态,站点识别和LicenseKeeper系统扩展的版本编号等一般信息。当这窗口打开时,Navigator将没10秒钟更新一次应用程序的使用信息。

更多的LicenseKeeper信息
计算机启动时,LicenseKeeper将自动寻找网络的区信息和每个区的dongle服务器。只有标识号与LicenseKeeper系统扩展相符的dongle服务器才能够被识别。这允许1台以上dongle服务器在相同的网络的范围内操作。如果网络管理员改变了有dongle服务器的区名并重新启动dongle服务器,那末区外的所有终端机也必须重新启动。
系统扩展作为Dongle Server成功启动时,在启动期间会出现这个图标。
系统扩展作为终端机成功启动时,在启动期间会出现这个图标。
系统扩展被安装,但是由于较少的内存或失活(启动时按下了鼠标)而不能启动时会出现这个图标。

WINDOWS上的安装与升级

通过因特网升级
必备条件 18
下载升级程序 18

软件安装
必备条件 19
从CD安装Lasergene 19

通过英特网升级

如果您以前已经安装了Lasergene 而且目前有升级和服务联系,您就可以通过英特网来升级您现有的版本,各种模块(module)都是以自解压形式存储的,你可以选择性的下载安装。

必备条件
您的用户名和会员号是必需的,可以在安装盘上找到。

程序升级
备份您已有的Lasergene,找到您要升级的执行程序,并把它转移到备份的文件夹中。
连接到DNAstar网站的主页(http://www.dnastar.com),从菜单中的Customers中点击Lasergene Updates点,安提示输入密码和用户名(与会员名相同),这样就会打开下载页面。
找到windows软件(Windows 95/98/NT Software.),就可以下载您想要的模块了。
模块下载完毕以后,双击文件将其解压缩完毕。
看到“Application name” has been updated.说明升级完毕。

软件安装

本节介绍若何从CD在PC机(Windows)上安装Lasergene。注意安装是尽量关闭所有其它程序以保证安装顺利进行。

必备条件
一张个人的Lasergene安装盘;
一张Lasergene软件光碟;
足够的硬盘空间和内存:至少30Mb的硬盘,32Mb的RAM。

从光盘安装Lasergene
插入安装盘和安装光盘,双击安装图标,则出现下面的窗口,点击继续则出现安装窗口。
随后一次出现下面窗口,请按照提示做出选择然后点击Next,直至完成安装。
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