【求助】microRNA表达谱的芯片检测
丁香园论坛
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我想咨询一下你们公司能不能帮助检测人类细胞的microRNA表达谱，我有正常的大肠癌HT-29细胞，以及RNA干扰后的HT-29细胞，我想检测对比下两类细胞microRNA表达谱的变化情况，特别需要包含miR-183,miR-1224-3p,miR-1184,miR-1205,miR-1207-5p,miR-486-3p,miR-423-5p,miR198,miR-455-3p,miR-214,miR-922,miR1226,miR1287,miR-512-3p,miR-148b,miR-542-5p,miR-323-5p,miR-515-5p,miR1248,miR-1237,miR-361-3p,miR-582-5p,miR-1225-5p等。请问这样的芯片有哪些国外公司的比较好？
Agilent的microRNA芯片比较好！
详细的情况看：http://www.ebioservice.com/show_product.asp?id=450
Agilent microRNA芯片技术特点
1. 唯一能通过特殊的探针设计区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台；
2. 无需分离miRNA，直接用Total RNA 进行实验，只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验（不包括质检所消耗的量），避免了分离、富集、放大等过程带来的影响；
3. 样品适用范围广：组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验；
4. 高特异性：特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异；
5. 高灵敏度：检测丰度跨4个log，最高可达6个log，只要存在6000个拷贝的分子就可以检出；
6. 数据来源于Sanger 13.0版本，并方便及时更新；
7. 人、大鼠、小鼠之外的动物物种，可以方便的通过earray进行个性化定制。
详细的情况看：http://www.ebioservice.com/show_product.asp?id=450
Agilent microRNA芯片技术特点
1. 唯一能通过特殊的探针设计区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台；
2. 无需分离miRNA，直接用Total RNA 进行实验，只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验（不包括质检所消耗的量），避免了分离、富集、放大等过程带来的影响；
3. 样品适用范围广：组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验；
4. 高特异性：特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异；
5. 高灵敏度：检测丰度跨4个log，最高可达6个log，只要存在6000个拷贝的分子就可以检出；
6. 数据来源于Sanger 13.0版本，并方便及时更新；
7. 人、大鼠、小鼠之外的动物物种，可以方便的通过earray进行个性化定制。
Intra-Platform Repeatability and Inter-Platform Comparability of MicroRNA Microarray Technology 《Plos One》
Concordance among digital gene expression, microarrays, and qPCR when measuring differential expression of microRNAs 《Biotechniques》
补充2份文献，对多个miRNA高量平台进行了比较，如Agilent、Affymetrix、Illumina、Exiqon、NGS、Q-PCR等。研究表明，Agilent miRNA芯片是最好的miRNA芯片。
Concordance among digital gene expression, microarrays, and qPCR when measuring differential expression of microRNAs 《Biotechniques》
补充2份文献，对多个miRNA高量平台进行了比较，如Agilent、Affymetrix、Illumina、Exiqon、NGS、Q-PCR等。研究表明，Agilent miRNA芯片是最好的miRNA芯片。
如果有200份标本，费用多少？
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师兄微信号：shixiongcoming
