【求助】microRNA与两个靶基因
丁香园论坛
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网站预测了某个microRNA有两个不同的靶基因,而且,这两个基因都已证实与某一种疾病相关,并两基因间存在相互调控机制。
我应该如何设计实验呢?
我应该如何设计实验呢?
这个说起来很简单啊,但是操作起来是比较麻烦的。首先我还是建议你先用生物信息学软件,多用几个预测一下,因为需要实验验证是比较麻烦的事情。如果可以我建议你分为以下几步来验证你的实验:
1.首先构建miRNAs表达质粒!构建质粒注意事项请参考丁香园相应主题。
2.然后讲呢的target的3’UTR连接到荧光素酶的下游。请参考相应文献怎么做。
3.共转染miRNAs质粒和target的3’UTR,检测作用结果。(特别提醒:在共转染之前请用PCR验证你的miRNAs质粒是否表达,否则前功尽弃)
1.首先构建miRNAs表达质粒!构建质粒注意事项请参考丁香园相应主题。
2.然后讲呢的target的3’UTR连接到荧光素酶的下游。请参考相应文献怎么做。
3.共转染miRNAs质粒和target的3’UTR,检测作用结果。(特别提醒:在共转染之前请用PCR验证你的miRNAs质粒是否表达,否则前功尽弃)
你先做预测吧,看看文献,多用几个在线软件预测,然后取交集,只用一个网站预测得结果不准确。第二步算一下自由能,去掉自由能过高得靶基因。然后剩下的再用试验验证。试验验证的程序园子里有很多,你搜一下。
To poisonkq:
请教一下如何计算自由能,能详细介绍一下吗?
我的邮箱pot 2001@163.com,万分感谢
请教一下如何计算自由能,能详细介绍一下吗?
我的邮箱pot 2001@163.com,万分感谢
chengxin913 wrote:
To poisonkq:
请教一下如何计算自由能,能详细介绍一下吗?
我的邮箱pot 2001@163.com,万分感谢
Mfold可以计算。
Mfold可以计算。
能介绍的具体一些吗?刚刚去看了一下,没太弄明白,谢谢!
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Mfold可以计算。
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——————————————————————————————————————————————————————————————————————————-对,建议大家公开交流。
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Mfold可以计算。
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