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Northern Blotting反应

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3175

北方杂合反应的步骤主要包括:

(1) 加入核酸探针,使与固定于尼龙膜上的特定RNA 进行杂合反应;

(2) 待杂合反应结束后以含盐缓冲液与SDS 洗掉非专一性结合于尼龙膜上的核酸探针。 进行反应时应注意下列几个问题:

a. 实验操作过程仍应尽可能避免RNase 的污染;

b. 反应前应先进行杂合前置反应(prehybridization),以便减少核酸探针与尼龙膜的间的非专一性结合反应;

c. 如果所使用的核酸探针是以random priming 或PCR 等方法所制备的双股DNA 探针,使用前务必先加热变性;

d. 选用适当的严苛度 (stringency) 进行杂合反应及后续的转印膜漂洗工作,以便增强杂合反应讯息,并减少噪声,这主要可以从温度与盐浓度两个方面加以考量。

仪器用具:Crosslinker (Stratalinker 1800, Stratagene);塑料盒;平端镊子;封口机;42℃恒温槽;60℃恒温槽

药品试剂:6×SSC (0.9 M NaCl, 90 mM sodium citrate)尼龙膜;Hybridization solution [formamide, 50% (v/v); 5×SSC; blocking reagent, 2% (w/v);N-lauroylsarcosine, 0.1% (w/v); SDS, 0.02% (w/v)]3MM 滤纸;2×SSC, 0.1% SDS;0.1×SSC, 0.1% SDS

方法步骤:

1) RNA 转印步骤结束后,移除电泳胶上的吸水纸与3M 滤纸。

2) 把尼龙膜连同电泳胶一齐移置于干净卫生纸上,并请小心维持电泳胶与尼龙膜的相对位置。

3) 以防水笔在尼龙膜上标出电泳胶样本孔的位置,并以剪刀剪掉尼龙膜左上角,以便标记电泳胶的左右方位。

4) 小心地拉开尼龙膜,将的放置于6×SSC (20 mL) 浸泡5 min.

5) 以平端镊子夹起尼龙膜,待6×SSC 滴干的后,把尼龙膜平放于卫生纸上,风干至少30 min.与电泳胶接触的那一面应朝上。

6) 以Stratalinker 1800 进行uv 连结反应。

7) 杂合前置反应:

a) 将10 mL 杂合溶液注入一个塑料袋。

b) 把已经风干的尼龙膜移置于塑料袋内,小心地把气泡移除的后,以封口机密封好,再移至42℃恒温槽进行杂合前置反应1~2 h.

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