玻璃奶法快速纯化回收DNA片段
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本方法有多种用途,主要包括:
从琼脂糖凝胶中分离纯化DNA片段;
从DNA反应物中纯化目的DNA片段,如回收纯化PCR产物、酶切连接反应中的DNA片段;
从探针制备反应物中去除未标记上的核苷酸以及小的DNA片段(比如引物);
DNA浓缩、去盐及去除杂质。
本试剂盒的主要成分“基因纯”试剂是无毒、无味、无腐蚀作用的白色颗粒,能专一性结合0.2kb到50kb大小的DNA(双链或单链,线性、环状或超螺旋),不结合RNA、蛋白质、寡聚核苷酸、有机溶剂、去污剂及其它可能抑制酶活性的有机或无机物。
一、使用本法回收DNA片段有以下优点:
高纯度:回收的DNA片段基本上不含RNA、蛋白质及其它有机分子,可直接用于酶切、连接、探针制备、序列测定等;
简便:所需主要仪器是一架台式离心机;
快速:整个回收过程只需半个小时;
高效:回收得率达到70%以上;
多用途:可以同时作胶回收、PCR产物回收、DNA片段及探针的纯化浓缩等;
安全:不接触苯酚、氯仿等有害物质。
二、试剂盒组成
1.碘化钠溶液: 50ml
2.DNA洗涤液(20倍浓缩液):10ml
3.“基因纯”试剂: 1ml
4.超纯水: 1ml
使用前,将DNA洗涤浓缩液(10ml)倒入一玻璃瓶中,加140ml无水乙醇及50ml蒸馏水(由使用者自配),混匀后置于-20℃冰箱中,其余溶液置于4℃冰箱。
三、操作步骤
从琼脂糖凝胶中分离纯化DNA片段
a. 常规DNA电泳。按常规方法用溴化乙锭(EB)染色DNA,而后将欲分离的DNA带从胶上切割下来,置于一1.5ml离心管中。
b. 称出凝胶带的重量,加入三倍量(V/W)的碘化钠溶液。(如0.1g凝胶中加入0.3ml碘化钠溶液)。
c. 置于55℃水浴5-10分钟,直至凝胶完全溶化。
d. 加入20μl充分混匀的“基因纯”试剂(建议使用前用漩涡振荡器振荡3分钟),室温放置5分钟(期间不时将管子颠倒几次以混匀)。
e. 离心10秒(10,000rpm),倒去上清液。
f. 加0.8ml刚从冰箱中取出的DNA洗涤液,充分摇匀,离心10秒,去上清。
g. 重复步骤f两次(共洗涤三次)。
h. 用吸水纸仔细将管壁上及管底残留的洗涤液吸干。
i. 加入20μl超纯水,混匀后置于55℃水浴5分钟。
j. 离心3分钟,将上清液小心吸至另一个离心管,即为纯化的DNA。可直接用于酶切、亚克隆、PCR、标记、探针制备、序列测定、细胞转染等。
注意事项:
溴化乙锭染色后的DNA易受紫外光破坏,故尽量放置于暗室,切带时应使用长波长紫外灯,切胶时间尽量短。
DNA洗涤液应保持在低温,否则可能使DNA从“基因纯”试剂上脱落而导致回收率降低。
步骤h是另一关键,管壁和管底残留的洗涤液若不完全除去,可能导致“基因纯”试剂上结合的DNA无法由蒸馏水洗脱。
PCR反应物中纯化目的DNA片段
PCR反应完毕后,加蒸馏水至100μl(最后体积)。
加入300μl碘化钠溶液,混匀。
以下步骤与“从琼脂糖凝胶中分离纯化DNA片段”中步骤d到j相同。
从探针制备反应中除去未标记上的核苷酸及小的DNA片段
探针制备反应完毕后,加蒸馏水至100μl(最后体积)。
加入300μl碘化钠溶液,混匀。
以下步骤与“从琼脂糖凝胶中分离纯化DNA片段”中步骤d到j相同。
DNA浓缩,去盐及去除杂质
加入3倍量的碘化钠溶液于样品DNA溶液中(若DNA为固态,则先将之溶于适量水或TE中,再加3倍体积的碘化钠溶液)。
加20μl或更多的“基因纯”试剂(每μl该试剂可吸附0.3ugDNA,操作者可根据这一指标自行决定“基因纯”试剂的用量,但不应少于10μl)。
以下步骤与“从琼脂糖凝胶中分离纯化DNA片段”中步骤d到j相同。