Atlas™cDNA表达距阵(Expression Array)
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AtlasTM cDNA表达距阵(Expression Array)
同时对588种/1176种关键基因做全景表达图谱分析,同时对大量已知基因的表达进行大规模高通量(High-htroughput)分析
检测关键基因在细胞关键功能中的角色
只需简单的杂交步骤
就在数年前,核酸矩阵技术只能在资金雄厚的大实验室开展。但两年前(1997),随着Clontech公司推出AtlasTM cDNA矩阵,情况大为改观。现在,cDNA矩阵已广泛应用于生命科学的诸多领域如功能基因组研究、新药开发和分子诊断等等。
Atlas™是世界上第一个商品化的高通量地分析基因差异表达的产品。它精心挑选生命现象中扮演关键角色的多个基因,并按基因功能分类点于一张膜上。
为提高信噪比,AtlasTM采取许多巧妙措施,如:
⑴.每个基因选取其特异性的cDNA片段,大小在200-600bp之间(最适于杂交的大小);
⑵.不含重复序列、同源序列和poly-A区;
⑶.经过扩增后,以管家基因进行均质化(normalization)点于膜上;
⑷.膜上还带有作为阴性对照的大肠杆菌或者噬菌体基因。
每个kit含两张膜(588个基因)或四张膜(1176个基因),所以两个不同来源的mRNA样本可以在一次实验中进行比较。通过杂交获取膜上的588个基因或1176个基因在两组mRNA样本中的差异表达。每张膜至少可以重复使用3次。
另外,Atlas™提供一种专利的合成杂交探针新方法。在第一链合成过程中,使用专利的基因特异性引物而不是使用oligo(dT)或随机引物,这就降低了探针的复杂度,进而提高了约10倍的灵敏度,减少非特异性背景,而且可以用total RNA代替mRNA作为探针合成的模板。
Atlas™的另外一个优点是:探针既可以用32P标记,也可以用33P标记。二者的区别:33P探针杂交图象质量很高,但是价格昂贵,而且灵敏度低;32P却非常适于低丰度基因表达的检测。
近年来,Clontech公司不断推出新研究热点的cDNA Array,您可以通过其公司网址上网查询有关资料,也可以向ebiotrade.com客户服务部索取。
Atlas™ Human cDNA Expression Array Cat#7740-1
人类功能基因组研究的有力工具
包括许多在不同生命过程中起关键作用的基因
结果信息量大
588种人类cDNA点于一带正电的尼龙膜上,另外还包括9个管家基因和质粒、噬菌体等阴性对照。cDNAs按功能分类置于不同板块。
人类基因组计划大规模测序得到几千种基因的部分序列,虽然许多基因已经被归于不同的功能类,但是他们在生物学过程中所起的真正角色还不是太清除,而要明白这些的一个重要步骤就是确定基因表达型(如比较基因在不同组织或不同进化阶段的表达)。
Atlas™ 不仅提供cdNAs list,也提供GenBANK的准入号。
Atlas™ Human Cancer cDNA Expression Array Cat#7742-1
监测治疗后分子生物学
区分关系相近肿瘤的诊断工具
分析在肿瘤发生中起关键作用的基因的表达
588种与癌症相关的cDNA点阵于一带正电的尼龙膜上,另外还包括9个管家基因的质粒、噬菌体等阴性对照。cDNA按分子途径和家族分类置于不同板块,包括癌基因、抑癌基因、细胞周期相关基因和凋亡等。
Atlas™ Mouse cDNA Expression Array Cat#7741-1
分析转基因或其他用小鼠作模型实验的基因表达
分析小鼠进化或肿瘤发生的分子机制
筛查在许多生命现象中起关键作用的基因
588种小鼠cDNA 点阵于一带正电的尼龙膜上,另外还包括9个管家基因和质粒、噬菌体等阴性对照。CDNA如图所示按分子途径或功能分类置于不同板块。
大量的基因图谱分析可以用于研究基因间的相互作用,以解释由基因的表达结果得到的表型现象.例如,比较不同疾病或不同进化阶段或实验的不同时间其基因表达的差异。基因表达图谱可以作为基因分类或定性的一个有力工具,也可以作为没有表型差异的小鼠的有力区分手段(如转基因小鼠或Knockouts小鼠和普通小鼠的区分)。
Atlas™1.2 Array and Atlas™1.2 Human Cancer cDNA Expression Array (each with 1176 genes)
1176个基因点在同一张膜上,提高cDNA点阵密度,使每次杂交能获取更多的基因表达信息,并降低实验成本。