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站在牛人的肩膀上科研

丁香学霸

1015
三年博士研究生生活,有很多感触,希望这些经历和想法能对大家有一点点的帮助。
 
一、 有关文献阅读和检索
对于刚刚进实验室的我们来说,检索和阅读文献是首先必须要认真做好的,这是整个研究生学习阶段最重要的一步。老师在实验室所推行的 weekly report 是非常好的培养方法,如果每一位新进实验室的研究生在整个学习阶段都能够这样执行,收获将是非常大的。下面是一些具体的做法。
 
1、 中文文献:刚进实验室的时候,很多人都会感到很茫然,内心里有很多想法,浑身也后使不出的劲,到处都是看不完的文献,但就是不知道从哪里下手。个人感觉首先阅读 CNKI 和万方数据库的优秀硕博士论文对于寻找课题和开拓思路很重要。首先选好你所感兴趣的方向,下载大约 10 篇左右的论文,好好的读一下。等这些论文读完了,基本上对该方向的实验方法,实验思路和相关的英文单词都有了一定的了解。如果有武大的同学的话,可以上武大的数据库,相对华工的来说,它的比较全,且新一些。对于我们实验室发表的一些文章,尽量的读一些,读的懂更好,读不懂也没有关系,但需要对我们实验室有一些了解。
 
2、 英文文献:主要就是 Pubmed。基本的方法就是在其检索栏中输入关键词,可以找到你所需要的大部分文献,通过学校图书馆可以下载绝大部分全文。如果不行的话可以通过以下方法获取:
①Pubmed 里面有个 Linkout 选项,当其首选数据库不能够查到全文的话,可通过 Linkout 链接到其他的数据库查找;
 
②向国外通讯作者索取,有时候给别人发了 email,别人不理你,不要怕,继续发,或者换个邮箱发,我们常用的 163 或 sina 有时候国外就收不到。不管别人给不给你全文都会给你答复的,越牛的人越会给你回复。
 
③上 DXY 检索区求助,基本上是有求必应,特别是你的积分大于 20 分的时候。所以需要自己在 DXY 上回答别人的问题以获得积分,给别人帮助,收获的是自己。
 
当你在 Pubmed 上查文献的时候,有很多重要的信息需要注意:
 
①在 Pubmed 的 Abstract 状态下,右边是其链接全文的网址,下面是与这篇文献相关的文章,这些文章很重要,需要仔细看看。
 
②进入全文网站之后,在全文的右侧有这篇文章被引用的次数,在文章的最后有引用改文章的文献列表,这些非常重要。
 
③ 关于引用文献可以查 Scopus 数据库,很全很新的。查找这些引用文献,可以找到很多与你所查文章相似的文献,有时候的收获比直接在 Pubmed 里面查还要多得多。
 
3、 文献整理和归纳:有时候明明查到多该文献,但过一段时间就是找不到,关键的原因是我们对文献的整理和归纳不够。个人感觉一下几点需要注意:
 
①文章的名称一定要写明,有时候直接下的时候它都是数字或字母表示,一定要当时就更改过来,有时候文章名很长,就需要我们给其简化命名;
 
②用关键词建立文件夹,并标明日期(如 CR-20080705);
 
③如果对文献管理软件如 endnote 或 references manager 熟悉的话,用这两个软件管文献会非常方便,但个人感觉并不推荐这种用法,因为我们用的都是 D 版软件,万一那天被限制使用了就完蛋了;
 
④经常整理,将相关的文献合并,改删的就删。
 
二、 关于课题设计和实验手段
掌握了基本的检索方法,并且阅读了一些相关的文献之后,就需要对自己的课题做一些基本的规划。
 
1、 课题设计:总的原则是在老板课题的范围之内选题,同时提出自己新的想法。老板的课题都是大的方向,有时候是非常好的 idea,但具体的实施过程也需要我们去创新,要把握基本原则,但又不拘于表面形式,这样才能把我们的想法和老板的课题完整结合起来。个人感觉研究生开题报告是一个非常重要的培养过程,写一份开题报告非常能够锻炼能力和思维。其内容可以与老板的课题相结合,但最好是提出自己的新思路。同时如果每年每位研究生都能够写一份国家自然科学基金或省自然科学基金的标书,这种锻炼对研究生尤其重要,同时也可以给老板提供一些好的 idea。
 
2、 实验手段:了解实验室常用的方法技术(从理论原理到基本的操作),精通一种实验技术(能够解决该门技术中大部分的问题)。比如我们实验室大部分人都会膜片钳,但我个人感觉精通的人并不多。实验技术只是手段,实验的思路才是最重要,同时必须掌握一门核心技术,这样就可以和人合作,与人交换。在实验上能够赢得合作者的尊重同时能够保证实验又快又顺的进行。为了掌握实验技术,对于刚进实验室的师弟师妹们来说很关键的一点就是要学会打杂,要舍得吃苦,不要怕吃亏。你给师兄师姐们做了很多无私的贡献的同时,你也学到了实验技术,同时还建立了良好的个人关系,这些非常重要。今天的付出,也许很多年后才有回报,但没有付出就永远不会有回报。吃苦耐劳,与人为善在任何时候都是适用的。
 
三、 关于论文的撰写和投稿
论文的撰写是个非常锻炼人的过程,需要耐心、细心和平常心。
 
1、 总的一些看法:最初写英文基本就是抄,选择 20 篇左右的相关英文文献,将其中的关键句子标明出来,使用的时候对于语法和整个句式不要做大的修改,主要就是改一些名词,副词和形容词。在使用的时候句子来源于 introduction 的就用在你的 introduction 之中,来源于 discussion 就用在你的 discussion 之中。在撰写过程中,我们不能保证我们的用词都非常恰当,也无法保证语法不出错误,但有几点错误是绝对不能犯的:①单词拼写;②文中的插图的标注;③参考文献的引用。这几点出错的话审稿人会认为你不严谨,想当然对你的实验结果产生看法。为了保证减少以上错误,有几点可尝试:①使用 word 的拼写和语法功能;②将文章多给几个人看看,不要太保守,怕别人知道你在做什么;③ 自己在不同的时间点看看,一定要打印一份出来,这种查错方法很不错的。
 
2、 Introduction 撰写:基本上是三段式:①首先是介绍与你课题相关的前人研究进展;②提出自己想做的问题;③你做了那些内容,有一些什么基本的意义。
 
3、 Results 撰写:①你的结果相互之间没有很必然的联系,但都是为了证明你的实验,他们是并列的关系,基本上按照别人文章的排序进行就行了,自己不要搞创新,免得到时候自己都说不清楚;②结果是递进式的,如研究信号通路,按照前后次序就行;③大多数是前两种方式的混合,需要多想想,自己明白是没有用的,关键是要让别人看得懂,因此写文章时多和人交流非常重要。
 
4、 References:建议用 endnote 软件进行管理,学会使用这个软件可以减少编写 references 的错误,可以减少工作量。软件很复杂,个人觉得知道使用以下方面就可以了:①会用 endnote 上 pubmed 查到你要的文献;②能够将你选择的文献插入到 word 文档中;③懂得选择适合你的参考文献方式;④ 如果有兴趣的话懂得编辑参考文献方式更好。
 
5、 文章中的插图制作:①建议用 PPT 操作,它做出的是矢量图,结果非常清晰,用 arial 的字体,8-10 号,excel 图表直接复制到 PPT 中;②画图板和 PS 做出的组合图都比不上 PPT;③个人感觉 sigmaplot 和 excel 做的统计图没有很大区别,是在 PPT 中进行组合的时候比较的;④在 PPT 中作图最初是不用管其像素,但其宽度一定要设定好,PPT 的横图基本上就是一个页面图;⑤投文章是可以用 PDF,当 PPT 做好后,可以用 adobe 软件将其转化成 PDF;⑥如果需要 tiff 的话,在转化成的 PDF 中截图到 PS 中,然后调整像素和大小,这种方式好像比直接复制到 PS 中的效果要好的多。
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