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8.27 Nat Biotechnol 揭示干细胞移植排斥反应新机制;哈佛开发多蛋白同时成像新技术

生物学霸

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① 禁食可以减少炎症,且不会降低免疫力!Cell 最新文章又一力证

我们知道热量限制会改善炎症和自身免疫性疾病,但对于减少热量摄入,控制炎症的机制却知之甚少

西奈山研究人员利用人体和小鼠免疫细胞进行研究,结果发现间歇性禁食可减少血液循环中称为「单核细胞」的促炎细胞的释放。进一步的研究表明,在禁食期间,这些细胞会进入「睡眠模式」,而且比未禁食的人体内发现的单核细胞更少。

这项新研究指出,短期和间歇性禁食可以减少慢性炎症,改善慢性炎症性疾病,而且不会影响免疫系统对急性感染的反应。

原文检索:Dietary Intake Regulates the Circulating Inflammatory Monocyte Pool


Nat Biotechnol 重大进展!揭示干细胞移植排斥反应的新机制

一项由加州大学旧金山分校(UCSF)移植和干细胞免疫生物学 (TSI) 实验室与国家心脏、肺、血液研究所 (NHLBI) 移植基因组学实验室、斯坦福大学合作完成的最新研究表明成熟到 ipsC 转换过程可以使线粒体 DNA 发生突变。这些突变可以触发免疫反应,导致小鼠和人类排斥诱导多能干细胞,以及更普遍的干细胞移植。

为了证明这样的线粒体突变可以触发免疫反应,科学家们创造了混合干细胞,其细胞核 DNA 来自一种小鼠品系,线粒体 DNA 来自另一种小鼠品系。他们将这些细胞移植到具有相同核 DNA 的小鼠体内,但其线粒体 DNA 在两个蛋白编码基因中只有一个碱基不同。移植后几天,他们从小鼠身上获取免疫细胞,并将细胞暴露于各种线粒体蛋白片段中。唯一引起反应的蛋白质是由这两个「外来」线粒体基因产生的。

原文检索:De novo mutations in mitochondrial DNA of iPSCs produce immunogenic neoepitopes in mice and humans


Nat Biotech 重大突破:哈佛尹鹏组开发组织中多蛋白同时成像的新技术

为了更好地理解组织和器官是如何发育、功能衰竭以及随着时间的推移而再生的,研究人员想要在三维空间中可视化它们的组成细胞的分子库。「人类生物分子图谱计划」、「人类细胞图谱计划」和几个大脑图谱计划等雄心勃勃的计划正在进行中,这些计划旨在绘制出许多蛋白质 (基因表达的产物) 在人体器官和组织中单细胞水平上的存在和丰富程度。然而,现有的成像方法在性能、对研究人员的可访问性或两者兼而有之方面通常都受到限制。

一项近日发表在《Nature Biotechnology》杂志上、由哈佛大学生物工程研究所和哈佛医学院 (HMS) 一组由 Peng Yin 博士领导的研究小组完成的最新研究已经填补了这个空白,他们开发了一种新的基于 DNA-纳米技术的称为 Immuno-SABER(Immunostaining with Signal Amplification By Exchange Reaction 的简称)的方法。该方法将常用抗体的蛋白靶向特异性与基于 DNA 的信号放大策略相结合,使同一样本中的许多蛋白能够在每个目标位点上通过预先可编程和可调的荧光信号进行高度复杂的可视化。该团队已经在广泛的细胞和组织样品中验证了他们的方法。

原文检索: Immuno-SABER enables highly multiplexed and amplified protein imaging in tissues


科研人员完成新版树鼩基因组测序 填补首版约 73% 拼装缺口

树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物,为灵长类动物的近亲,在生物医学研究中颇具潜力。目前,树鼩已被用于感染性疾病如乙型肝炎、丙型肝炎、疱疹病毒感染、禽流感病毒感染等模型创建,在视觉系统研究、近视模型,以及一些肿瘤模型构建方面,显示了很好的前景。

近期,来自中国科学院昆明动物研究所姚永刚课题组的博士范宇利用单分子实时测序技术,结合高通量染色质构象捕获技术测序数据,完成了新版的树鼩基因组高精度测序、组装和注释。这一版树鼩基因组填补了第一版基因组中约 73% 的拼装缺口 (163,220 个),其中处于基因编码区的缺口全部得到填补。此外,新版树鼩基因组中,蛋白编码基因的数量与序列长度较第一版基因组有明显的质量提升,基因结构的精确度也明显上升。

原文检索:Chromosomal level assembly and population sequencing of the Chinese tree shrew genome


⑤ Nature:开发出泛素剪切技术,提供关于泛素信号转导的新见解

澳大利亚的研究人员是世界上最早接触到一种了解复杂变化的新方法的人之一,这些变化控制着蛋白在健康和疾病中如何在我们的细胞中发挥功能。

这种称为泛素剪切(ubiquitin clipping)的新型蛋白质组学技术允许人们构建蛋白如何被一种称为泛素化的过程修饰的高分辨率图谱。这种技术为理解泛素化在细胞中的作用提供了新的细节水平,并且可能揭示导致包括癌症、炎症和神经退行性疾病在内的一系列疾病的微妙变化。

原文检索:Insights into ubiquitin chain architecture using Ub-clipping


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