如何用 Image J 计算细胞划痕?
ZSCI
细胞划痕实验是一种简单易行的检测细胞运动的方法,实验成本低,可以用来检测贴壁生长肿瘤细胞的侵袭转移能力。
划痕实验大家会做,那么如何将这一大批的图片进行实验距离的测定呢?
Image J 又要派上用场了,它不仅可以用于分析 DNA 电泳 WB 条带的灰度值、细胞计数、细胞共定位,就连细胞划痕面积一样可以计算!
一、划痕实验的实验原理和步骤
先简单的回顾下划痕实验的实验原理和实验步骤。
1. 实验原理
细胞划痕法是测定肿瘤细胞的运动特性的方法之一,是在体外培养的单层细胞上划痕致伤,观察肿瘤细胞的迁移情况。
2. 实验步骤
① 培养板接种细胞之前先用 marker 笔在 6 孔板背面画横线标记(方便拍照时定位同一个视野);
② 细胞消化后接入 6 孔板,数量以贴壁后铺满板底为宜(数量少时可培养一段时间至铺满板底);
③ 细胞铺满板底后,用 10μL 枪头垂直于孔板制造细胞划痕,尽量保证各个划痕宽度一致;
④ 培养板接种细胞之前先用 marker 笔在 6 孔板背面画横线标记(方便拍照时定位同一个视野);
⑤ 加入含有 4 μg/mL 丝裂霉素(防止细胞增殖过快)的完全/基础培养基,拍照记录;
⑥ 将培养板放入培养箱培养 (不同时间点取出拍照);
⑦ 利用 Image J 分析实验结果。
二、标尺校正
1、不进行标尺校正,得到的长度单位为 pixel(像素),面积单位为平方像素(pixel2)。
2、打开一张带有标尺的图片,选择直线工具,在标尺上沿着标尺画一条直线。
3、点击【Analyze】→Set Scale
4、点击 Click to Remove Scale,再在 Known distance 填 250μm,然后在 Unit of length 填入单位(μm)
5、选择 Global 为对之后打开的图片都有效(必选项)
三、划痕距离测定操作步骤
1、划痕面积
① 面积检测方法(划痕距离测量为等效测量)
划痕宽度平均值 = 划痕空隙面积/长度。
细胞迁移率 =(0 h 划痕宽度-培养后划痕宽度)/ 0 h 划痕宽度×100%
② 转化灰度图
选择【Image】,点击【Type】,然后在点击【8 -bit】
③ 增强对比
点击【Process】,然后选择【enhance contrast】
【Saturated pixels】中选择 0.3,默认 Normalize,最后点击【OK】
④ 平滑+寻找边缘、阈值设定
平滑边缘:Process→Smooth(Ctrl+shift+S)
寻找边缘:Process→Find Edges
阈值设定:【Image】→Adjust→Threshold(Ctrl+shift+T)
⑤ 设置和选择
选中为红色,调节阈值为 0 - 20。点击【Apply】
选择【工具栏】中的魔棒工具,在划痕面积处点击
弹出的 Wand Tool 中的【Tolerance】选择 2,点击 OK, 然后再在【Anlyze】-Measure , 注意其中 Tips:Ctrl+M
2、划痕长度
画线:点击【工具栏】中的直线选择工具',纵向画一条笔直的线
分析:Ctrl+M
四、结果分析
1、面积分析
2、长度分析
细胞迁移率 =(235.274 - 131.495)/ 235.274×100%= 44.30
五、操作小结
灰度转化:在所有步骤前,必须进行灰度转化。
增强和对比:突出划痕区域,便于后续魔棒选择划痕区域。
参数设置:该步骤(魔棒选择区域)可能一次不成功,可在参数设置区进行调整。
单位:若未校正则面积或长度单位均为像素,即 pixels2 或 pixels。