CAMP - 安利一个分析膜蛋白相关信号通路的神器
实验万事屋
原来想给你们找找看有没有什么更好看一些的信号通路工具,但最后发现了这个:
CAMP,大家应该也都知道,信号通路最初始是从膜受体接受到信号后,往下传递的。而很多膜受体,也是药物治疗靶标和肿瘤标记物。
CAMP 就是用来搜索信号通路中膜受体相关信息的,比如,不同的肿瘤中,可能传递的信号通路也未必一样,不同的影响,对肿瘤的生存预后也不一样。比如,给你们搜一个 EGFR:
就出现了这么一个简陋的 Network 图……
我们也可以通过筛选,选择不同的肿瘤:
实际上这个 Network 图上,也会直接显示相关的肿瘤以及信号通路的信息,比如,点到这个胰腺癌:
除了表达有差异的基因,还有相对应的 EGFR 在胰腺癌中的生存曲线:
同时也会显示出 EGFR 已知有证据的互作蛋白等等:
点进去,则是互作的具体实验方法等信息:
当,点到信号通路的时候,则会显示 EGFR 相关的这个信号通路在肿瘤中的生存曲线……
以及信号通路中这些蛋白,对于 EGFR 表达的相关性:
如果你是研究膜蛋白的话,CAMP 可以给你一些相关的提示,比如,这个膜蛋白是否对于下游通路有影响,是否在其他研究的肿瘤中有差异等等。作为标书路上的简单提示也是好的,也能从互作和表达相关两个点上,找出可能相关的基因。
这个工具是台湾省交通大学的作品哈…… 有兴趣的就自己去搜一搜,搜不到的话,要么回复 「公克」(不要在评论区回复),或者星球上见(当然,进不去也无所谓)。
好了,今天就先策到这里吧,祝你们心明眼亮。
网站链接:http://campnets.life.nctu.edu.tw/index.php
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