Graphpad 作图教程 | 这份超详细的生存曲线绘制指南,科研新手一看就会!
肿瘤专业的小伙伴一定经常用到生存曲线,1928 年生存曲线(又称存活曲线)首次由美国生物学家雷蒙·普尔提出,它可以反映不同种群在每个年龄段生存的数目。1958 年,Edward L. Kaplan 和 Paul Meier 也首次在临床研究中提出了生存曲线的概念,又被称作 Kaplan-Meier 曲线,主要用来对各组患者的生存状况进行描述。
而作图神器 graphpad prism 8.0 也可以做生存曲线,接下来给大家介绍步骤:
1. 打开软件,survival 模块下, 选择 start with sample data to follow a tutorial 及三组数据。
2. 点击 ok 后出现下图 data 数据,X 轴代表天数,Y1、2、3 分别用 0 和 1 表示,1 代表死亡;0 代表存活。
3. 数据填充好了后,下一步就是进行数据分析了:点击 results 模块下的 survival of three groups,生成下图的分析结果:
由于是三组数据,所以我们可以进一步两两比较:
3.1 分别比较 AB/AC 数据:点击 analyze,按下图分别进行选择
3.2 进入下图对话框进一步选择:
上图中:
①Log rank 检验:进行两组或多组生存曲线的比较,检验统计量在大样本时近似服从 X2 分布自由度为分组数- 1;
②Log rank 趋势检验;
③Breslow:检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数为权重;
④Y 轴的表现形式:有 percent survival/death 和 fraction survival/death 四种选择。
4. 三组数据一起分析以及 AB/AC 两两分析结果如下图:
5. 统计分析结果出来了,最后一步就是作图了:选择 graphs 模块,按下图进行选择:
与完全数据相反,如果在研究结束的时候,研究对象发生了研究之外的其他事件或生存结局,无法明确的观察记录到发生终点事件的生存时间,这种类型的数据称删失数据 (Censoring data),或不完整数据 (Incomplete data)。
6. 点击 creat 后草图形成,如下图。然后按照个人习惯调整曲线的颜色、样式以及粗细。
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